人體
根據上述之外爲陽、內爲陰;上爲陽，下爲陰;背爲陽，腹爲陰的規律，則人之皮毛在外爲陽，臟腑在內爲陰;頭在上爲陽，足在下爲陰。
生理
人體的健康與否，決定於陰陽的是否調和，如《內經》所說：“陰平陽祕，精神乃治”。人體攝取飲食後，經過脾、胃的腐熟運化，將營養物質運送至全身各處，使肉體增長強壯、使生命活動力旺盛。食物消化後有形的廢料，由前後二陰排出。人體之陰陽若是保持在平衡的情況下，人體就健康。
病理
人體陰陽失去平衡後，就會表現出各種症狀來，古人對症狀的分類，也是用陰陽來代表和說明的。陽證，一般表現的症狀是：發熱、口渴、脈數(快)等，這類症狀，古人又稱爲熱(即陽)證。陰證，一般表現的症狀是：不發熱，口不渴、手足冷、脈遲(慢)等，這類症狀，古人又稱爲寒(即陰)證。這就是《內經》所說的：“陽勝則熱，陰勝則寒”。
另陰陽偏衰，是指陰或陽低於正常水平的失調，其一方低於正常水平，而另一方保持正常水平，或雙方都不同程度的低於正常水平，故出現虛證。陰不足，陽正常則陰虛生內熱;陽不足，陰正常則陽虛生外寒;陰陽雙方都不同程度的不足，則虛寒、虛熱並見或陰陽兩虛。這就是“內經”所說的“陰虛生內熱，陽虛生外寒”、“陰陽兩虛”證。
診斷應用
陰陽是診斷的總綱。疾病雖然很多，但其屬性不外陰陽兩類，如從疾病發展部位來看，不在表(陽)，就在裏(陰)。從疾病性質來看：熱證(陽)，寒證(陰)，從疾病發展趨勢來自看：實證(陽)虛證(陰)。總之，陰陽可以概括疾病的屬性。
治療應用
中藥種類甚多，但就其性能不外陰陽兩類，從藥性來看：寒、熱、溫、涼、溫熱屬陽，寒涼屬陰。從治療上總原則是“調整陰陽，以平爲期”，這就是治療的基本出發點。針對陰陽盛衰，採取補其不足，瀉其有餘，使陰陽偏盛偏衰的異常現象得到糾正，恢復其相對平衡狀態。中醫常用“寒者熱之，熱者寒之，實者瀉之，虛者補之”的治療原則，促使失調的陰陽重新恢復到相對的平衡。臨牀上借藥性之偏，來糾正人體陰陽之偏，使達到“陰平陽祕，精神乃治”。臨牀具體用法：①陽虛和陰勝則寒，治法：寒者熱之(用熱藥);②陰虛和陽勝則熱，治法：熱者寒之(用寒藥);③正氣不足，治法：虛者補之;④邪氣偏勝，治法:實者瀉之;⑤陰不足、陽偏亢，治法：滋陰潛陽;⑥陰陽兩者均不足，治法：滋陰助陽(陰陽雙補)。
