相傳當時有一鄉婦懷孕得病，一到中午就痛苦不堪，淚流不止，很多醫生束手無策。陳自明知道後遣人告訴其家屬：這是內臟燥熱引起的，應用大棗湯治。病人家屬不信，請人查證醫書，正如陳自明所說，用此方一劑病就好了。成年後，醫術精進，名揚四方。
陳自明的醫療思想非常積極，他認爲“世無難治之病，有不善治之醫;藥無難代之品，有不善代之人”。他的醫德非常高尚，治病不論貧富，一視同仁，隨到隨診，對特殊困難者，不取分文。對於一些貪人錢財的庸醫，斥爲“用心不良”。當時有的醫生得到一兩個驗方，便祕不外傳，有的還將常用的驗方改頭換面當做祖傳祕方，予以炫耀。陳自明十分反對這樣做，將自已家傳的許多驗方揉合於上述兩書中，公之於世，因而深爲人們所稱道。他在《外科精要》自序中說：“僕三世學醫，家藏醫書若干卷，既又遍行東南，所至必盡索方書以觀，暇時閉關靜室，翻閱涵泳，究及末合”。於醫學理論加以深刻探討，對中醫婦科與外科進行了精深的研究和全面的總結，著有《管見大全良方》(已佚，僅在《醫方類聚》一書中存有散在內容)、《婦人大全良方》、《外科精要》等。是我國醫學史上一位傑出的婦產科專家。
陳自明總結了宋以前婦科學的研究成果，並結合自已的臨牀實踐，闡發了婦科疾病的病因病機，頗具特色，對後世婦科學的發展很有影響。明代王肯堂著《女科準繩》、武之望著《濟陰綱目》均受其不少的影響。對於外科癰疽的治療，他從病因、病機、辨證、治療到預後，均作了較爲系統的論述。其中，強調整體治療，注重陰陽分證，注意保護脾胃，主張內外合治，是其主要成就，頗受後世醫家的讚賞。如汪機著《外科理例》，王肯堂著《瘍醫準繩》，均大量採錄陳氏之說，可見其影響之大。
