軼事一
授御醫”及乾隆帝賜匾額——“妙悟岐黃”傳說如下。
乾隆十五年(公元1750年)，黃元御行醫北京，適遇乾隆皇帝病重。太醫院與京城名醫多方調治無效，帝痾漸沉，百醫束手無策。當時，宮中有一太監爲昌邑玉皇廟村人，深知元御醫術高超，便向朝廷推薦，詔進時黃氏辭曰：“敝乃草民，不懂軍臣大禮，恐萬歲見責，有欺君之罪。”乾隆帝傳諭：“免恕一切，至宮廷時對朕面只行叩首之禮。”並令侍官帶奉銀及綾羅緞匹爲禮，再詔黃氏進宮。黃氏辭曰：“無功不受祿，敝乃布衣之士，豈敢接受。”帝怒，再賜以五品頂戴，按品賜銀，再次傳進。黃氏見再難推委，遂入宮。乾隆欲試其醫術高低，故虛設一帳，令宮女臥其內，只露一手於帳外，讓元御診脈。診畢退出，侍官請處方，元御道：“龍體鳳脈，無藥可醫，恐不久於人世。”侍官回奏，乾隆聞言心悅誠服，乃知其爲良醫，即令御診，診后帝問：“朕得何病，應用何方治療?”元御道：“萬歲小恙，乃七分藥毒三分病，須先進兩帖去藥毒，繼服一帖治所病。”帝允諾，按方配服，病豁然而愈。乾隆帝大喜，賜以重金，元御皆堅辭不受，說： “吾非爲官爲錢，願爲社稷治病救人”。皇帝便命他入太醫院爲御醫，並賜其楸木棋盤、玉石棋子一副，常與對弈，遂號玉楸子。乾隆十六年二月，乾隆帝南巡，黃元御奉詔侍從，隨駕武林(杭州)，治途爲人治病屢驗，著方調藥皆神效。皇帝感其學識，親書御匾“妙悟歧黃”，懸於太醫院門首。黃氏於太醫院任職期間醫術日益精湛，治癒多起皇宮貴族的疑難雜症，晚年更是著書立說，爲中醫學發展做出諸多貢獻。乾隆二十三年黃元御於行醫、著述中積勞逝世，歸葬祖地。
此雖系軼事傳說，然對黃元御醫術之精湛，性格之清高，乾隆帝這位明君的性格處事等，描述得極爲精闢。參之黃元御《四聖心源》自序：“帝眷之隆，何可恃也”，當有一定的真實性，而非純系杜撰。
軼事二
黃氏鄉居，以醫負盛名。其女遠嫁，生一子，出痘，勢甚危，抱歸求治。黃氏一見，即怒詈(li,音利)，不過日晡(bu,讀第一聲，申時也)，其速行!”其女長跪乞憐，黃氏不顧，呼人急駕騾車送之返。時赤日中天，輿人故遲遲其行，中途遇大雨，周身盡溼，輿人乃駕車回黃家，蓋黃氏預囑之也。時已日暮矣，黃氏率家人正佇立門外，燈籠相候，語之曰：“汝子生矣。此證內人已極，非用此法，不能挽救。吾默察天時，知今日午後必有大雨，故弄此狡獪(jiao kuai,音角快)，不然，汝子豈能生哉!”遂處方與服，痘果透發而愈。
軼事三
黃氏嘗夏月出行，有數人見其至，相與謀曰：“黃氏號爲名醫，吾儕(chai,音柴)蓋試之。”一人故仆地，急招黃氏診。黃氏曰：“此人僅能延數刻耳，哀哉!”羣嗤之以鼻。黃氏曰：“毋!聽其預言。汝等初意，乃與餘爲戲也，不知今當夏月，溼熱交蒸，此人仆地之時，熱毒之氣已從口鼻吸入，內又有腸胃之病，感之而發，其來也暴，非藥石所能瘳(chou,音抽)矣。”衆不信，黃乃行。未幾，其人果腹中絞痛，不數時即斃。人皆嗟嘆，共稱黃術如神。
軼事四
黃元御五代傳人麻瑞亭(1903—1997)，早年聽其業師李鼎臣講述過黃氏診病軼事一則，簡述如下。
時年黃氏在太醫任上，瀋陽一王爺之子病篤，遣人詣京，求乾隆帝委太醫往診，帝即命黃元御前往。即日起程，乘轎奔赴，夜不住驛，轎中假寐;食不下轎，果腹而已。至瀋陽，直奔王府，報名而入，徑往正堂，王爺降階相迎。方落坐，黃氏未及請問，王爺即欲述其子病情。黃氏曰：“臣進府時，聞東廂有呻吟之聲，可是小爺?”王爺對曰：“正是。”黃氏曰：“無須診視，其肺已腐爛不堪，無藥可醫，惜哉!”王爺聞言，面露驚愕之色，旋即面如冷鐵，起身曰：“先生少坐，本王去去卻回。未幾，侍者捧一盤呈與堂，視之，其內耐一腐爛人肺也，濁血流溢。黃氏大驚失色，方欲問其故，王爺已手握匕首而至，雙手及利刃盡染血污，抱拳稽首曰：”先生神明，本王佩服!適才已將犬子殺之，此乃其肺也，果如先生所言。”黃氏驚倒在地，面如土色，張口結舌，無言以對。稍定，乞歸。王爺允請，黃氏即刻起程，形容一如赴沈急促之狀。至京，拜表奏乾隆帝診病及王爺殺子始末，謝罪並乞歸故里休養。帝不究其直言之罪，好言撫慰，準其所請。未及陛辭，即匆匆返籍，病臥不起。其子請問病由，黃氏祥告之，並曰：“爲父已膽破神傷，醫藥無及，尚有百日陽壽，速請好友故舊一決!”果百日後而逝，時年五十有四。
按：《丹徒縣誌》載，有顯貴延視女病、不知其在室也，斷爲孕，且言必男。少頃，已剖腹出胎來示。大驚，“耳遂聾”，名益震。這就是大名鼎鼎的王九峯，呼稱王聾子的來源。而非黃氏之經歷。
軼事五
軍醫館久真堂的祖師爺。
鑑於第一次金川之戰大批清軍水土不服、疾病纏身，致使戰鬥力低下、傷亡慘重的情景，據說乾隆皇帝認爲軍士病症皆是經絡不通，氣血不循，正氣不足造成，所以着尊經派的太醫院御醫——黃元御署理川軍軍醫館——久真堂，提供解決將士水土不服之症的方略。
臨危受命的黃元御仔細瞭解了藏區的氣候，官兵高原缺氧和高寒以及流行的傷寒、咳嗽等形象，予以將宮廷的祕方、宮廷中御藥房中治療肺病、咳嗽最好的藥材和藏區的蟲草、貝母、紅景天等等名貴藥材爲伍，又使用人蔘、天麻、鹿茸、靈芝、桑黃等名貴滋補藥材作爲強勁官兵體魄的藥引子，還把宮廷御藥房銀質藥具和部分宮廷御藥房作人一同前往成都，祕製出各類強勁體魄，提高免疫力，抗高原低氧環境的膏、丹、丸、散用於清軍攜帶服用，以克各類低氧、傷寒、咳嗽、倦怠、疲憊等病症。期間黃元御通過了解士兵症狀和用藥效果，完善和補益了他的《長沙藥解》的著作。所幸，雜谷土司之亂很快平定，但是軍醫館——久真堂的祕製膏、丹、丸、散在駐軍中引起了良好的反應，獲得了很高的讚賞，皆尊奉黃元御爲久真堂的創始祖師爺，在軍醫館的大堂懸掛乾隆手書褒獎黃元御“妙悟岐黃”的牌匾爲榮，軍醫的醫師皆自詡御醫之門生。
乾隆三十六年(1771年)在第二次大小金川之戰中，定西將軍阿桂首先整肅兵馬，除了在汶川、打箭爐駐軍沿途設置多處湯藥處，遵照已過世黃元御爲久真堂留下的各類研究方略，製造各類抗病膏、丹、丸、散劑，還特選13位軍中勇士，根據不同體質用黃元御留下的醫方調配，用上等的藏區蟲草、貝母枇杷膏等給予服用。13位勇士服用該配方後非但晝夜不倦不病，反而越戰越勇，最終取得勝利。乾隆大喜下特意褒獎久真堂上下醫師。並准許懸掛着乾隆皇帝御筆親書的“妙悟岐黃”牌匾，遵照“仁道藥濟”的行醫理念濟世救人。
