苗族的圖騰崇拜有龍神、楓木、鳥、盤瓠等。苗族對龍普遍崇拜，各地苗鄉都很盛行。如：貴州黔東南苗族地區的“招龍”;湖南湘西地區的“接龍”;雲南屏邊、硯山、麻栗坡等到境的“祭龍”;廣西融水縣境的“安龍”等。
各地苗族都是爲了祈求風調雨順，五穀豐登、家道興隆、普澤萬民而紛紛求助於龍。貴州黔東南臺江、凱里交界地區的苗民，認爲龍是爲人作善、保佑人們平安發達的靈物，所以，如果在那個寨裏出現有啞巴兒童多、山坡成片倒塌、家族內有男女青年關係異常等現象時，就認爲這是保佑本村人畜興旺的龍神已離開的不吉利預兆，就當舉行“招龍”活動，把龍神請回來。於是，全村的人共同商定吉日，集資購買祭品，請鬼師來主持“招龍”儀式。“招龍”儀式一般選擇在一個吉日的傍晚進行。 苗民很崇拜楓木樹，他們的村前寨後都有楓木。爲了祈求保佑，人們還給老楓樹燒香、掛紅，一時祭祀;修建房屋也必須找大楓木作第一個中柱，才能發富發貴。
不僅如此，人們還把楓木比作自己的祖先。如把“我們是一個祖先”說作Bib(我們)dios(是)jus(一)dius(棵)det mangx ngul(楓樹)，直譯是“我們是一個棵楓樹”。黔東南苗族流傳有一首很長的古歌——《楓木歌》(hxak det mangx ngul)視楓木爲繁衍子孫的始祖。
如同整個苗族一樣，苗族的信仰仍屬於“萬物有靈”的多神教原始宗教範疇，但也有獨特的地方，表現了明顯的圖騰崇拜傾向。在三穗縣的寨頭、巴冶、良上、稿橋、稿米及劍河的岑鬆等地，民間的信仰習俗與宗教信仰構成了較爲完整的宗教同信意識，而且，這一帶的民間信仰習俗具有明顯的多層複合性特徵。
最近，在三穗縣的寨頭村發現有一座被稱爲“黑神廟”而淹沒了多少年的蚩尤廟，廟裏供有蚩尤像、祖傳木鼓、土地菩薩、觀音大士外，還供有三對水牛角(惜於解放前夕毀於一旦，現恢復後的“蚩尤廟”僅存一隻祖鼓，解放前的供物在60歲以上的人中還記憶猶新)具有典型的多神多教“和平共處”的特色，構成了這一帶苗族人民民間諸神系統和複雜的信仰對象。
“蚩尤廟”在苗語中稱爲“嘎尤”(ghed youl，這裏，ghed 是苗語中祖父輩以上分及祖的稱謂，youl即蚩尤)，義爲“尤公”。
“嘎尤”在這裏並沒有“廟”的意思，則專指蚩尤。廟裏同時供有蚩尤像、祖鼓和牛角，又通稱爲“嘎尤”，可見羣衆眼裏，“嘎尤”即牛角，牛角即“嘎尤”，“嘎尤”即祖鼓，祖即“嘎尤”，“嘎尤”、牛角、祖鼓是三位一體的、不可分的“嘎尤”。至於土地菩薩、觀音大士等神祗，並不包括在“嘎尤”裏面，都是後來“擠”進去的多神系統。以神祗面目出現的民俗信仰事項，它所反映的問題的實質性要較其他民俗事項反映深刻，其可信程度也要遠比其他民俗事項要高，因爲它的變異性要比其他民俗事項小得多。顯然，將祖鼓、水牛角和蚩尤像三位一體稱爲“嘎尤”，至少可以證實水牛中與蚩尤的關係即水牛角是蚩尤的族徽，水牛是蚩尤族的圖騰是歷史的本來面目。
貴州凱里、黃平、麻江、雷山等縣苗族自稱爲“嘎鬧(ghabnes)”的，據考“ghabnes”即“鳥”的意思。這是遠古苗民的鳥圖騰崇拜的反映。
此外，據苗族學者石建中、麻樹蘭稱：目前，湖南的瀘溪、沅陵、麻陽、鳳凰、花垣、吉首等縣的苗族，都崇拜盤瓠，不僅到處有盤瓠洞、盤瓠廟的遺址，而且還有關於盤瓠的傳說。苗族極個別地區的極少數人有生殖崇拜的現象，但隨着社會的發展，這一現象已消失。
和其他兄弟民族一樣，苗族的圖騰崇拜產生於原始社會氏族公社時期。它在不斷的歷史演變過程中，形成了豐富多彩而富於適應性的圖騰形式。被稱爲圖騰制奠基者的佛來善說：“一個圖騰就是一類物象，初民以迷信態度尊敬之，而相信自己和同羣的各個份子與此類物象有密切和特殊的關係”。苗族現存圖騰活動是以龍爲物象的。她把龍作爲自己的祖宗、保護者和象徵，作爲本族的族徽和標誌;把自己視爲龍的後裔，受到龍的保佑而繁衍發展起來，故虔誠地對龍加以崇拜，對被認爲是龍的化身之物，禁殺、禁食、禁辱，嚴爲保龍，神聖不可侵犯，崇龍心理及其活動的神祕性、嚴肅性、廣泛性，嚴密地維繫着全族的精神思想。
