在帕查庫特克 (1438-1471)的統治之下，開始了印加歷史上非凡的領土擴張。根據西班牙人的記載，在帕查庫特克的統治期內，印加獲得了它全盛時期三分之二的領土。儘管有帕查庫特克任期較長的原因，但是，考慮到印加人有限的運輸和通信方式，這種擴張已經是相當迅速的了。當時，不僅還沒有開始使用車輛，甚至當地連馬匹都沒有。
所獲得的這些擴張的領土部分只是印加軍隊征服計劃的附屬品。征服戰不斷的通過粉碎鄰國的頑強抵抗而取得勝利，並因此能夠殘忍的入侵別國。但是，並不是所有帝國擴張所得的土地都是直接通過軍事行動獲得的。有一些領地的加入來自於帝國的和平建議。其它一些領地的加入則是因爲害怕一旦拒絕帝國締結聯盟的建議，將會導致殺身之禍。
大約1470年的時候，印加人戰勝了位於祕魯北部海岸的奇穆王國，該王國不僅富有，而且強大。隨着這次主要征服戰役的勝利，南美洲剩下的小國中幾乎再沒有能夠挑戰印加帝國的國家存在，更不用說阻止印加帝國的擴張了。因此印加帝國的擴張遍及南美，隨後組成了所謂的南美“文明世界”。
在印加的王位繼承人圖帕克·印卡·尤潘基(1471-1493)繼承王位之前，印加帝國的邊界已經推進到了今天厄瓜多爾共和國的北部邊界。在圖帕克·印卡·尤潘基在位期間，又征服了祕魯的南部海岸(1476)，智利的北部，阿根廷西北部的大部分地區，以及玻利維亞高原的一部分。帝國巨大領土的一部分，很明顯沿着祕魯的南部海岸線，而且征服的代價也是高昂的，戰爭的結果不僅給交戰雙方都帶來了巨大的損失，甚至導致了某些小部落的整體滅亡。另外，在先前征服的那些土地上定期發生的暴亂又不得不被鎮壓。
在西班牙入侵之前的最後幾年，印加帝國仍然在北部進行着擴張。瓦伊納·卡帕克(1493-1527)，印加王朝最後一代帝王阿塔瓦爾帕的父親，在他1527年離世時，已經統治了位於厄瓜多爾首都基多的帝國北部前沿。
