1939 年，津田兼任東京帝國大學法學部講師，講授東洋政治思想史。日本右翼主義者蓑田胸喜?三井甲之等人以此爲藉口，發表論文對津田展開了猛烈攻擊，將津田斥爲“惡魔般的員最兇恨的虛無主義思想家”。隨着日本右翼勢力的快速增強，1940年2月10日，日本政府以其研究內容“對皇室不敬”頒令將津田著《古事記及日本書紀的研究》、《神代史的研究》、《日本上代史的研究》、《上代日本的社會及思想》等4書予以封禁。
同年，在文部省的要求下和早稻田大學的施壓下，津田彼被迫辭掉早稻田大學教授一職。同時，因蓑田等人的上告，津田與出版者巖波茂雄被以違反出版法罪名遭到起訴，1942年5月，津田、巖波被判有罪，津田被判處3個月，巖波被判兩個月有期徒刑，皆爲緩期執行。津田不服上述，直到1944年失效而免予起訴。這就是當時轟動學術界的“津田事件”。
津田史學的核心爲“皇國史觀”否定論，從而形成獨樹一幟的“津田史觀”。這一史觀成爲日本戰後歷史學的主流思潮，津田因而被尊奉爲日本現代歷史學的巨匠。
