馬倫哥戰役是拿破崙執政後指揮的第一個重要戰役。這次戰役的勝利，對於鞏固法國脆弱的資產階級政權，對於加強拿破崙的統治地位都有着重要的意義。
馬倫哥戰役在軍事史上的地位和作用，歷來受到人們的重視。我們認爲，拿破崙在這一次戰役的指導上，是有其突出特點的。
首先，他有效地製造和利用了敵人在判斷上的錯誤，真正做到了出敵不意，出奇制勝。出敵不意，攻其無備，這是拿破崙慣用的作戰手段。在他第一次進軍意大利的戰爭中，曾經非常出色地採用過這種戰法。但是，那一次僅僅侷限在戰役和戰術範圍之內，而在馬倫哥戰役中，這種手段已經擴大到了戰略範圍。戰役開始前，奧軍認爲，法軍只能從亞平寧山進入北意大利，別無他路。這是法國人在歷史上入侵意大利經常所走的一條老路。這一次，拿破崙一反常規，偏偏避開了他在第一次意大利戰爭中也曾走過的那條路線，而選擇了一條歷史上很少有人走過、在一般人眼裏根本無法通行的道路。結果，完全出乎奧軍意料之外，達成了戰略上的突然性，收到了戰略奇襲的效果。正由於這一戰略奇襲，他成功地避開了梅拉斯的主力，彌補了自己兵力的不足。
戰役開始前，爲了隱蔽自己的真實企圖，造成敵人的判斷措誤，拿破崙成功地採取了一系列戰略性的欺騙和僞裝措施。例如，在瑞士方向故意示弱於敵，有效地隱匿了預備軍團的真實面目和行軍路線，並使敵人錯誤地判斷了法軍的真實企圖。事實證明，馬倫哥戰役不愧是戰略欺騙和戰略奇襲的一個傑作。
其次他機敏地抓住了決定整個戰役勝負的關鍵，能夠在複雜的形勢下趨利避害，避實就虛。趨利避害，避實就虛，這是克敵制勝的要訣，強軍必須恪守，弱軍更要遵循。拿破崙率領預備軍團翻過大聖伯納德山口，進入北意大利後，面臨着兩種選擇：一種是迅速南下，增援馬塞納，傾全力解熱那亞之圍，使意大利軍團免遭覆滅的厄運;另一種是暫時置馬塞納於不顧，迅速揮師東進，直取倫巴第的首府米蘭，遮斷奧軍退路，以求一舉切斷奧軍主力與本土之間的聯繫，迫使奧軍北撤，爾後與其進行決戰。拿破崙從戰役全局出發，審時度勢，權衡利弊，作出了選擇後者的正確決策。
當時，拿破崙如果揮師南下，去解熱那亞之圍，那麼，勢必過早地與奧軍主力決戰，這就很容易被強敵擊敗，而且，那時法軍後方交通不暢，尚有後顧之憂，貿然與奧軍決戰，一旦失敗，後果是不堪設想的。相反，揮師東進以後，馬塞納軍雖有覆沒的危險(實際上後來馬塞納也率部投降了)，但是，這卻可以避敵精銳，擊其虛弱，格矛頭指向敵人最薄弱和最敏感的部位，可以奪得敵人的後方基地，切斷敵人賴以生存的交通線，從而在根本上動搖敵人，在精神上給敵人以巨大震撼。後來的事實證明，拿破崙這樣做的結果，造成了極其有利的態勢，爲奪得戰役的勝利創造了條件。
第三，他沉着冷靜地應付着險象叢生的戰鬥環境，在關鍵時刻指揮若定，臨危不懼。對一般將領來說，在情況發展順利時，指揮自如，並不是一件怎麼困難的事情。要在情況危急關頭鎮定自若，做到臨危不亂，則是一項不大容易達到的要求。拿破崙在馬倫哥戰役中，正好顯示了這樣一個突出的特點。在六月十四日下午的幾個小時裏，法軍的處境可謂岌岌可危。按照一般人的看法，出現了這種情況，法軍肯定是必敗無疑了。可是，拿破崙卻仍然鎮定自若，繼續從容不迫地指揮部隊抗擊敵人的進攻，並且因而爭取了時間，等到了援兵的到達。儘管德賽率部隊及時趕到具有一定的偶然性，但拿破崙在這危急關頭的堅定態度，對於穩定法軍的情緒，鼓舞法軍繼續進行頑強的抵抗，無疑是有重要作用的。沒有他的堅定指揮，則法軍早在德賽的援軍到達以前就崩潰了。
馬倫哥戰役，無論在戰略計劃上，還是在作戰指揮上，都稱得上一個卓越的典範。
