早在1522年的時候，黎昭宗出逃山西，黎昭宗的母親鄭氏鸞與弟弟黎椿(即後來的黎恭皇)都未及隨行，留在了升龍。鄭氏鸞派人祕密出使明朝，通告了莫登庸驅逐國主之事。當時嘉靖帝剛剛繼位，派遣編修孫承恩、給事中俞敦詔諭其國，但在龍州聽說安南大亂，只得返回。1525年，黎昭宗遣使赴明朝貢並請求冊封，希望得到明朝的支持，但被莫登庸阻止。次年莫登庸賄賂欽州判官唐清，要求爲其所立的傀儡黎恭皇請求冊封，但唐清被兩廣總督張嵿逮捕入獄，冊封之事成爲泡影。
1528年，莫登庸篡奪後黎朝皇位之後，遣使赴明廷，聲稱後黎朝子孫滅絕，無人可以繼承皇位;臨終前囑咐讓大臣莫氏權管國事。同時宣稱莫氏得到了羣臣擁戴和百姓的擁護，請求明廷冊封其爲安南國王。嘉靖帝派人暗中前往安南訪查，得知莫登庸系篡位，因此暗中訪查黎氏子孫，並痛罵了莫朝的使者。莫登庸畏懼，重金嚮明朝進貢，雙方關係方纔和緩。此後不少後黎朝遺臣逃亡明朝通告其篡位之事，請求明廷協助恢復後黎朝，都因莫登庸通過向邊境官員行賄而失敗了。
1533年，流亡哀牢的後黎莊宗黎維寧策劃重建後黎朝，同時派遣鄭惟僚出使明朝，自稱世孫，通告莫登庸篡位之事。1537年，嘉靖帝下令列舉了莫登庸十大罪，令戶部侍郎胡璉、高公韶前往雲貴、兩廣調度軍糧，以咸寧侯仇鸞總督軍務、兵部尚書毛伯溫參贊軍務，以都督僉事江桓、牛桓爲左右總兵，準備發兵征討安南，但在嚴嵩、張瓚等人的勸說下取消了計劃。不久雲南巡撫汪文盛抓獲了莫朝的間諜，這使嘉靖帝大爲震怒，下令依照原來的計劃征討安南。汪文盛傳檄安南，若有擒獲莫登庸父子者，賞賜官爵及白銀萬兩;同時下書莫登庸處，稱若其能夠投降，即赦免其罪。
得到此消息後，莫登庸派遣阮文泰出使明朝，獻表請降。1540年，莫登庸留皇帝莫福海守國(此時莫登瀛已逝世，子莫福海繼位)，自己與侄兒莫文明以及大臣武如桂、杜世卿、鄧文值等四十餘人自縛，經過邊境的鎮南關(今中越邊境的友誼關)，前往汪文盛的軍中投降，頓首認罪;並獻上地圖和金銀珠寶等物，請求內屬明朝的欽州。同時割讓高平一帶的安廣、永安州、澌浮、金勒、古森、了葛、安良、羅浮諸洞土地給明朝。明朝遂取消了進攻計劃。
莫登庸派遣阮文泰、許三省等人赴燕京獻表投降，明將毛伯等人也來到燕京，奏稱莫登庸投降之事。嘉靖帝準其投降，令廣西布政司頒賜《大統歷》，封莫登庸爲安南都統使，子孫世襲此職，安南內政悉聽其管理。
與此同時，後黎莊宗派遣阮淦、鄭檢、鄭公能、賴世榮等人已經攻取了西都清化，佔據了南部的大片土地，在西都重建後黎朝。後黎朝的遺臣紛紛前去投奔，支持後黎朝的莫朝地方官員也紛紛倒向後黎朝，越南進入了南北朝時代。
1541年，莫登庸逝世，皇帝莫福海(莫憲宗)開始親政。死後廟號太祖，諡號仁明高皇帝，葬安陵(An L?ng)。
由於莫登庸篡奪了後黎朝的皇位，後來又嚮明朝歸還了很小部分越南侵佔中國的土地，傳統越南史官不承認莫氏皇位的正統性，並且給予莫登庸非常差的評價。近代越南歷史學家陳仲金對其評價也不好，稱他爲亂臣賊子和賣國賊。越共學者們對莫登庸的評價依然非常差，污衊莫登庸投靠外國，“非常無恥”。
