1467–70年間，國王愛德華和他曾經的良師益友，權利強大的沃裏克伯爵奈維爾之間的關係急劇惡化。這有幾個原因，但都主要起源於愛德華1464年決定祕密和伊麗莎白·伍德維爾(Elizabeth Woodville)結婚。愛德華後來宣佈關於他結婚的新聞爲既成事實，使得沃裏克極爲尷尬，因爲他曾商議愛德華和一位法國新娘的聯姻，他認爲有和法國結盟的必要。當伍德維爾家族在朝廷上比奈維爾家族受寵時，尷尬轉成了苦澀。其他的因素和沃裏克的幻想破滅交織在一起：愛德華傾向於和勃艮第(而不是法蘭西)結盟，以及愛德華不情願他的兄弟克拉倫斯公爵喬治(George,Duke of Clarence)和格洛斯特(Gloucester)公爵理查分別娶沃裏克的女兒伊莎貝爾·奈維爾(Isabel Neville)和安妮·奈維爾(Anne Neville)爲妻。而且，愛德華的受歡迎程度在此期間也處於減退狀態，因爲高昂的稅率和法律與秩序的經常性中斷。
到1469年，沃裏克和愛德華嫉妒和善變的弟弟喬治結成了同盟。他們組織了一支軍隊在Edgecote荒原戰役擊敗國王，並把愛德華扣在約克郡的Middelham城堡。沃裏克處決了王后的父親裏弗斯(Rivers)第一伯爵理查德·伍德維爾Richard Woodville。他迫使愛德華在約克召集國會，計劃將愛德華宣佈爲非法並將王位傳給喬治(Clarence)作爲愛德華的明顯繼承人。但是，國家處於混亂，愛德華能夠喚起他弟弟格洛斯特(Gloucester)公爵理查和大部分貴族的忠誠心。格洛斯特(Gloucester)在領着大軍前來解放了國王。
沃裏克和喬治(Clarence)被宣佈爲叛國者並逃往法蘭西，那裏路易十一在1470年正受到安茹(Anjou)的瑪格利特要他侵入英格蘭並幫她受俘的丈夫重新取得王位的壓力。正是路易建議沃裏克和瑪格利特建立聯盟，這個想法曾經爲敵的兩方面一開始都不覺得好笑，但最後在意識到潛在的利益時又都同意了。但是，雙方無疑同牀異夢：沃裏克需要一個傀儡國王亨利或是他年輕的兒子;瑪格利特要重新獲得她家庭的領域。無論如何，沃裏克的女兒安妮·奈維爾和瑪格利特的兒子前威爾士親王威斯敏斯特的愛德華的婚事被安排了，沃裏克並於1470年秋侵入英格蘭。
這次輪到愛德華四世被迫逃離，當約翰·奈維爾轉而支持他的兄弟沃裏克時。愛德華對奈維爾從北面來的大軍的到來措手不及只得命令軍隊分散。愛德華和格洛斯特(Gloucester)從唐卡斯特(Doncaster)逃到海岸線然後從那裏去往荷蘭並流亡於勃艮第。沃裏克成功從法蘭西侵入，他的解放並恢復亨利六世王位的計劃很快有了結果。10月，亨利六世在倫敦的街上作爲復位的國王遊行，而愛德華和理查被宣佈爲叛國者。但沃裏克的成功是短暫的。受到路易國王許諾的在尼德蘭的領土的誘惑，他過度擴張了他的計劃並隨法蘭西國王侵入勃艮第。這導致勃艮第的勇敢者查爾斯(Charles the Bold)支持愛德華。在1471年他提供資金和軍隊發動對英格蘭的入侵。同年愛德華在巴尼特(Barnet)戰役擊敗沃裏克。蘭開斯特的其餘部隊在圖克斯伯裏(Tewkesbury)戰役被滅，蘭開斯特的王位繼承人威斯敏斯特的愛德華王子被殺。亨利六世很快(1471年，5月14日)被謀殺，強化了約克家族對王位的佔有。
混亂爆發
1471年愛德華四世的復位有時被視爲玫瑰戰爭的結束。在愛德華其餘的統治時期和平恢復了，但是在1483年他突然死去之後，政治和王朝的混亂又爆發了。愛德華四世治下，王后伍德維爾的親戚裏弗斯(Rivers)第二伯爵安東尼·伍德維爾和多塞特(Dorset)第一侯爵托馬斯·格雷(愛德華五世的同母異父兄，格雷郡主的曾祖父)和其他憎恨伍德維爾新取得的在朝廷上的地位並視他們爲渴望權力的暴發戶的人之間形成了派系鬥爭。當愛德華過早死去，他的繼承人愛德華五世才12歲。伍德維爾家族處於可以影響年輕國王將來的統治的地位，因爲愛德華五世在拉德洛(Ludlow)在裏弗斯(Rivers)伯爵的監管下成長。這對於反伍德維爾的派系來講是不可接受的，在爭取攝政王位置和內閣的控制權的鬥爭中，有愛德華四世在病榻上任命爲英格蘭攝政王的愛德華的弟弟格洛斯特(Gloucester)公爵理查德成爲反伍德維爾派系事實上的領袖。
在威廉·黑斯廷斯(William Hastings)和亨利·斯塔福德(Henry Stafford)的幫助下，格洛斯特(Gloucester)在白金漢郡的史東尼·斯塔福德(Stony Stratford)從伍德維爾家族那裏俘獲了年輕的國王。此後愛德華五世被格洛斯特(Gloucester)拘禁於倫敦塔，後來他的弟弟9歲的約克公爵理查也被送到那裏。控制了兩個男孩之後，理查德宣稱愛德華四世和伊麗莎白·伍德維爾的婚姻非法，所以兩個孩子是私生子。國會表示同意並啓動王室權利(Titulus Regius)法案，正式任命格洛斯特(Gloucester)爲理查德三世(理查德還有一個哥哥克拉倫斯公爵喬治，先前因叛國罪被愛德華四世處死，理查德以此剝奪了喬治獨子的王位繼承權)。受關押的兩個男孩，也被稱爲“塔裏的王子(Princes in the Tower)”，失蹤了，可能被謀殺了;被誰謀殺以及誰下的命令現在依然是英格蘭歷史上最有爭議的主題之一。
因爲理查德是約克家族方面最傑出的將領，很多人接受了他爲一個更能保持約克家族權力地位的統治者，而不是一個必須通過攝政委員會進行統治的男孩。另一方面，蘭開斯特家族希望集中於亨利·都鐸，其父親里奇蒙第一伯爵埃德蒙·都鐸是亨利六世的同母異父兄弟。但是亨利對王位的繼承權是通過他母親瑪格利特·蒲福(Margaret Beaufort)，她是愛德華三世的後裔，因爲她是約翰·蒲福的後代，而約翰是愛德華三世的孫子，也就是岡特的約翰的私生子。
戰役結束
1485年，亨利·都鐸的軍隊在博斯沃思原野(Bosworth Field)戰役擊敗了理查德的軍隊，亨利成了國王亨利七世。然後亨利通過娶愛德華四世的女兒——約克家族最佳的繼承人約克的伊麗莎白爲妻來鞏固他的統治。這樣，他重新統一了兩個王族，把紅玫瑰和白玫瑰這兩個對立的符號合併到紅白都鐸玫瑰的徽章中。亨利通過一有機會就處決其他可能的王位繼承人來確保他的地位，其子亨利八世繼續了這個策略。
很多史學家以亨利七世繼位爲玫瑰戰爭結束的標誌。其他人則認爲玫瑰戰爭直到1487年的斯托克戰役(Battle of Stoke)之後才結束，該戰役因一名王位的僞冒者的出現而發生，一個名爲蘭伯特·西姆內爾(Lambert Simnel)的男孩長得很像約克家族最佳的男繼承人沃裏克伯爵。僞冒者的計劃從一開始就註定失敗，因爲年輕的伯爵還活着並被亨利國王所拘禁，所以沒人真正懷疑過他除了是騙子還能是什麼。在斯托克，亨利擊敗了林肯伯爵約翰·德拉波羅的軍隊(John de la Pole,Earl of Lincoln) —— 他被理查三世任命爲繼承人，但是在博斯沃思(Bosworth)戰役之後被亨利廢黜——這樣約克家族剩餘的抵抗實際上被除掉了。西姆內爾(Simnel)在叛變中的活動被赦免並被送去王室廚房工作。
