同治十一年(1872)九月，同治舉行大婚典禮，迎娶場面盛況空前。在新婚之夜，據說同治還對這位狀元之女進行了一番文學上的考察，阿魯特氏出口成章，對唐詩能夠背誦如流，令他愈加愛慕敬重。
阿魯特氏比同治年長，她以女性特有的溫柔和母性呵護着皇帝，在她的薰染下，同治收斂了孩子般的任性，逐漸變得成熟穩重。
兩人新婚燕爾，恩愛非常，招來了慈禧太后的不滿。慈禧對同治立阿魯特氏爲後早已耿耿於懷，爲了給皇后下馬威，她故意擡高鳳秀之女富察氏的地位，在冊封妃嬪時，富察氏被封爲慧妃，是品級最高的。按照慣例，妃嬪的冊封禮與皇后的冊立禮同日舉行。但在同治大婚之日，只有慧妃的冊封禮同日舉行，瑜嬪、珣嬪的冊封禮被安排到1個月以後。
現在看到同治與皇后纏綿廝守，恩恩愛愛，對她喜歡的慧妃卻不理不睬，守寡多年的慈禧不免生出了幾分妒意和惱意。她派太監監視皇帝皇后的行爲舉止，並對同治下諭：“慧妃賢惠，雖屈居妃位，宜加眷遇。皇后年少，未嫺宮中禮節，宜使時時學習。帝毋得輒至中宮，致妨政務。”
這話說得蠻橫無理，直截了當地說皇帝常到中宮，便是妨礙了政務，簡直是強行將同治從阿魯特氏身邊拉走。同治不敢違抗太后懿旨，卻也不願違背意願去親近他不喜歡的慧妃，於是乾脆獨居乾清宮。
阿魯特氏獨守空房，對於婆婆的強橫，她委曲求全，常常半夜垂淚至天明，但表面上絕不流露出半點不滿，對慈禧太后仍是恭敬。但是慈禧對她的反感卻絲毫無減，這主要也與阿魯特氏的性格有關。
阿魯特氏爲人不苟言笑，也不善逢迎。她深受禮教薰陶，端莊正派，有意無意襯托出慈禧的低俗。有一次，阿魯特氏陪同慈禧看戲，當臺上演到男歡女愛時，慈禧看得津津有味，她卻轉頭面壁，不願觀看，慈禧勸了多次，阿魯特氏也不願回頭，這讓慈禧非常難堪，對她愈加厭惡。
阿魯特氏身邊的人勸她要討慈禧歡心，處理好與慈禧的關係，她卻認爲對長輩尊敬即可，用不着對慈禧阿諛奉承。親人對她的處境感到憂心忡忡，阿魯特氏安慰道，她奉天地祖宗之命，由大清門迎入，地位不是輕易可動搖的。清制規定，皇帝大婚時，只有皇后的鳳輿才能經過大清門、午門、太和門到坤寧宮“降輿”，其他宮妃只能由神武門進宮。
探聽到皇后此言的太監加油添醋回報給了慈禧，這可惹惱了她。慈禧通過選秀女入宮，從低品級的貴人一步步攀上了權力頂峯，她最大的遺憾是沒能從大清門風風光光地入宮。
阿魯特氏的話讓慈禧想起了初入宮的低微身份，她咬牙切齒，認爲阿魯特氏故意輕視自己，從此有了將阿魯特氏置於死地的念頭。
