超日王之子鳩摩羅笈多一世(Kumaragupta I)(415-455年)在位期間，國內矛盾激發，那馬達河流域的普士亞密多羅人叛亂，國王派太子塞建陀笈多(Skandagupta)率軍鎮壓，幾乎被敗，戰爭間，鳩摩羅笈多一世逝世，塞建陀笈多(455-467年)繼位併成功鎮壓叛亂。未幾，嚈噠人來襲，由西北印侵入，塞建陀笈多再率兵擊退敵人。開頭還能抵抗一陣，保衛印度免於滅亡，後來就無法抵禦，國勢日頹，民窮財盡，以致不得不藉改革貨幣來維持現狀。
塞建陀笈多死後，內部分化及外族入侵更盛，笈多帝國的統治是通過笈多大王下面的地方公的鬆散組織來實現的，佛陀·笈多以後(約500)發生經濟危機，各地封臣叛離中央，國家陷於分裂。
當時嚈噠人滅了印度河上游殘餘的貴霜勢力，嚈噠國王頭羅曼成以犍陀羅爲據點大舉入侵印度，笈多的地方統治者反與嚈噠人結盟，嚈噠人在500年前後進佔朱木拿河及恆河流域。喪失西印，宣告笈多王朝的實際終結。
最後，僅在摩揭陀、阿逾陀一帶，保持殘局，是爲後笈多王朝。
517年，頭羅曼成出征回朝中死去，其子摩酰邏矩羅(即密希拉古拉，517-542年)繼位，再侵印度，531年抵瓜廖爾城，在那裏建太陽神廟，並立石歌功頌德，但不久被馬爾瓦的耶輸陀曼擊敗，退至印度河以西地區。
摩酰邏矩羅死後，嚈噠人對印度的統治瓦解，567年，薩珊波斯與突厥人夾擊下滅了嚈噠國。
嚈噠國的入侵對印度經濟政治造成嚴重破壞，笈多王朝的地方長官自我稱王，印度又再次分成小國。印度的分裂狀態持續了650年，其間只有戒日王曾成功統治北印度40年。
