奧陶紀-志留紀滅絕事件： 發生在4.4億年前，其間約有85%的物種滅絕。根據化石資料研究，當時可能有一顆10公里到12公里大小的 天體撞擊了地球，其威力相當於100億顆廣島原子彈爆炸，巨大塵煙包裹了地球，地球進入 冰河期，許多 無脊椎動物不能適應環境而滅絕。 葉足動物門和 古蟲動物門這兩類動物可能均是在這時瞬間消失的。
晚泥盆紀弗拉斯期-法門期之交大滅絕： 由於淺水中含氧量下降，海洋中無脊椎動物損失慘重。經過這次滅絕，70%的物種消失了，洋中的物種比淡水中的物種受到的影響更大，珊瑚、腕足動物、菊石、海百合等許多無脊椎動物損失慘重。
第三次：二疊紀-三疊紀之交大滅絕： 到了二疊紀，地球上一派欣欣向榮景象，海百合、菊石、珊瑚和魚類在海洋中異常繁榮，兩棲動物以及爬行動物進一步深入內陸活動，這段相對穩定的時期持續了大概1億年。到了二疊紀末期，大約在2.45億年前，地球歷史上最大的一次集羣滅絕事件發生了。據統計，這次滅絕事件導致生物科數減少了52%，物種數減少了90%以上。
第四次：三疊紀-侏羅紀之交大滅絕 在這一時期裏，牙形石類全部滅絕，菊石、海綿動物、頭足類動物、腕足動物、昆蟲及陸生脊椎動物中的多個門類，都走到了進化的終點。雖然這次大滅絕的損失相對較小，但它卻騰出了許多“生態位”，爲很多新物種的產生提供了有利條件，恐龍就是從此開始了它們統治大地的征程。此次滅絕起因很不清楚，不過降雨增加可能是一個重要的因素。
第五次：白堊紀-第三紀之交大滅絕 此次滅絕是地球歷史上第二大集羣滅絕事件，而恐龍時代就是在此終結。目前國外科學界普遍接受的一種解釋是，這次大滅絕是一顆巨大的小行星或彗星墜落到地球上，引起地球生態系統劇烈變化的直接結果。
