漢獻帝劉協比曹操小了28歲，相差了一代人還要多，因當時的大漢末年局勢讓他們走在一起，並彼此糾纏。對曹操來說漢獻帝是讓他在三國時期政治生涯上追重要的一個人也是對他人生的一大污點。
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說最重要，是因爲曹操得到漢獻帝后形成了“奉天子以令不臣”的局面，與其他勢力相比政治上更爲主動，同時有大批人才衝着復興大漢和漢獻帝而投奔了他，曹操集團因此快速壯大。
說污點，是因爲有人認爲曹操不是“成奉天子”而是“要挾天子”，把漢朝天子當成傀儡去篡權奪權，曹操因此受到要復興漢室的人的唾棄。在曹操控制下的漢獻帝因爲曹超對漢室權利的剝奪他對曹操也越來越不滿，曾不止一次試圖暗中除掉曹操。
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建安五年(公元200年)，漢獻帝對曹操獨攬漢室江山很是不滿，令他董貴人的父親車騎將軍董承想辦法去誅殺曹操。董承先後聯絡了劉備、種輯、吳子蘭和王子服等人，準備起事，結果事情被曹超知道，董承等人被誅殺，已懷有龍子的董貴人也被殺死，董貴人就這樣被曹操殺了，他無奈的卻什麼也幹不了。
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建安十九年(公元214年)，漢獻帝的第一任皇后伏壽因爲畏懼和厭惡曹操，寫信給他的父親伏完，信上寫的盡是曹操殘暴不仁的事，希望伏完能幫助漢獻帝剷除曹超。伏完還未行動，事情敗露被曹超的手下得知，然後曹操要挾漢獻帝廢了伏皇后，派人帶兵包圍皇宮搜捕，在一處夾牆內把伏皇后拖了出，伏皇后披頭散的發哭着向着漢獻帝求救，漢獻帝痛苦無奈地說：“我的命都不知能活到什麼時候!”
