清代總督，一般是正二品，加兵部尚書銜者爲從一品，另大學士銜者爲正一品。轄一至三省。清代總督例兼右都御史，加兵部尚書銜。統管一省或兩三省的軍事、行政，司法大權。
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清初，順治朝共設有十五個總督。分別是直隸總督(駐大名)、山東總督(駐青州，後改駐濟南)、江南總督(駐南京)、山西總督(駐太原)、河南總督(駐開封)、陝西(駐漢中)、福建總督(駐漳州)、浙江(駐溫州)、江西總督(駐南昌)、湖廣總督(舊制春季駐荊州，秋季駐武昌。後曾長駐荊洲，最終專駐武昌)、四川總督(駐重慶)、廣東總督(駐廣州)、廣西總督(駐梧州)、雲南總督(駐曲靖)，貴州總督(駐安順)，全國形成了十五總督並設的局面。
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到康熙年間，經過合併裁撤，到康熙四年十五總督改設爲直隸山東河南、江西江南、福建、浙江、山西陝西、湖廣、四川、廣東廣西、雲南貴州九總督。
至康熙末年形成了兩江、川陝、閩浙、湖廣、兩廣、雲貴等六總督的格局。經過這次調整，清朝初步確立了兩省設一總督的格局。
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到乾隆二十五年的時候，又恢復四川總督，改川陝總督爲陝甘總督，增設直隸總督。此後歷經嘉慶、道光、咸豐三朝基本無變化，最終形成了八總督格局，即湖廣、兩江、直隸、四川、兩廣、雲貴、陝甘、閩浙總督。另外在山東濟寧設立河道總督，總管運河黃河水務。
