泗州古城始建於公元579年，時爲北周宣政元年，因該城倚泗水而建故名泗州，泗州的具體城址在江蘇宿遷市泗陽縣鄭樓鄉。唐朝開元23年，唐玄宗將泗州遷址到泗洪縣最南端，在汴河和淮河的入口之處，以利於漕運管理。
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到了明朝時期，泗州城北有皇帝的祖陵，此地被視爲明朝的龍興之地。每當重大節日，皇室貴族、重臣高官雲集於此，舉行盛大的祭祀典禮。而這時候的泗州，經過一千年的發展，已然是一座繁華熱鬧、極具規模的城市。泗州城市輪廓呈橢圓形，裏面有住戶近萬，十五條街道三十四條巷子，寺廟、高塔、樓臺、祭壇等數十座，並且有裏城一座，輔城四十五座。
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泗州城地勢低窪，城內城外河溝密佈，是名副其實的水城。自建城以來，多次遭受洪水肆虐。尤其是清朝以後，統治者不懂疏導洪水，只會築造水壩攔水，造成了更大的安全隱患。1860年，在連下70天暴雨之後，泗州古城終於遭遇滅頂之災，帶着千年的榮耀淹沒在滾滾洪濤之中，並被厚厚的泥沙掩埋，在水底沉睡了三百年之久。同時，泗州古城是中國唯一的災難性古城，具有濃烈的悲劇色彩。
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關於這場水淹泗州的浩劫，民間一直流傳有各種傳說，讓它蒙上了神祕的面紗。1963年，在淮河上空出現了海市蜃樓的奇觀。泗州古城曾經的街道、樹木、人流、車馬隱隱約約呈現在空中，令人驚歎。
近年來，泗州古城漸漸浮出水面，面貌逐漸公開於衆。考古學者彙集在這裏，對古城遺址進行大量的發掘和研究。它原滋原味地保留了清朝時期的原狀，具有巨大的考古價值。目前，已經出土一批珍貴的文物。
