哈爾濱市社會科學院731問題國際研究中心對外公佈了一份檔案，這份抗戰期間日本參謀本部的命令文件，記載了當時日本天皇批准陸軍軍醫學校職員在731部隊兼職的情況，揭示出原日本陸軍軍醫學校與侵華日軍731部隊有着極爲密切的關係。
檔案顯示，1936年9月的日本參謀本部的文件《關於制定允許陸軍軍醫學校職員兼職爲關東軍防疫部職員之事》中，記載了日本參謀總長載仁親王給陸軍大臣寺內壽一的命令，以及日本天皇的軍令案——《軍令陸乙第四十一號》，文中顯示：“朕命令制定並實行陸軍軍醫學校職員兼職爲關東軍防疫部職員之事的方案”，而“關東軍防疫部”即爲731部隊。
據公開資料，關東軍醫務處處長梶塚隆二中將和731部隊總務部長川島清少將在俄羅斯伯力審判時的供述：“天皇曾下達敕令組建731部隊和100部隊”，但戰後731部隊成員和日本社會各界竭力否認他們在伯力審判時的供述，進而否認天皇知道並扶持731部隊的事實。
哈爾濱市社會科學院731問題國際研究中心負責人楊彥君說，此次發現的日本參謀本部文件《關於制定允許陸軍軍醫學校職員兼職爲關東軍防疫部職員之事》，能夠充分證明天皇知道731部隊的存在並扶持了731部隊的擴張，更進一步印證梶塚隆二和川島清供述是真實可信的，也足以證明731部隊是日本自上而下的集團犯罪、國家犯罪。
之前公佈的檔案還顯示，原日本陸軍軍醫學校和731部隊之間經常有大範圍的人員交流和調動，這些檔案包括731部隊人員調轉、家屬遷移等四類文件。特別是關東軍向陸軍省申請的石井部隊家屬遷移的人員名單、經費預算及使用明細，涉及了731部隊早期成員，是此前沒有公開過的資料。
據瞭解，在731部隊首任部隊長石井四郎的建議下，1932年日本陸軍軍醫學校創立細菌研究室，對外稱“防疫研究室”，731部隊就是在陸軍軍醫學校防疫研究室的基礎上建立的。1933年8月，日本在哈爾濱市南崗區祕密設立了石井部隊;1938年6月，石井部隊遷住哈爾濱平房區;1941年該部隊正式改稱“滿洲第731部隊”。
