1934年12月1日是蘇聯共產黨(布)中央政治局委員、列寧格勒州委書記基洛夫的一個照常工作日，但也是他生命歷程中最後一天。這也是即將席捲全國鎮壓狂潮掀開序幕的一天。這一天傍晚當基洛夫走進在列寧格勒州委機關所在地斯美爾尼宮，向州委第二書記的辦公室走去。當他在走廊裏停下腳步開門時，一顆罪惡的子彈射中他的脖子。他搖晃一下，轉了半個身子，就一頭栽倒在鑲木地板上了。他的帽子被掀落了一半，鮮血從傷口向外冒。兇手尼古拉·耶夫是內務人民委員會的工作人員。而且有證據表明，在這項謀殺之前，他曾幾次企圖暗殺基洛夫。
謝米·基洛夫喜歡在斯美爾尼宮中散步。尼古拉耶夫仔細地研究了他散步的路線，企圖靠近基洛夫卻被警衛人員逮捕。在他皮包背面有一處開口地方，可以不打開皮包就能抽出手槍，上了子彈的手槍就放在此處，裏面還裝有基洛夫的散步路線圖。尼古拉耶夫被帶到列寧格勒內務人民委員會。審問他的是委員會助理負責人扎波羅熱沃，但不久之後奉內務人民委員雅哥達之令釋放了他。
這引起基洛夫警衛人員的警惕。但內務人民委員會告訴他們：這件事用不着他們去管，並以收繳個別警衛人員黨證相威脅。最後尼古拉耶夫帶着武器潛入斯美爾尼宮，在基洛夫要通過那條走廊時向他開槍，慘案就發生了。
更令人奇怪的是當基洛夫的警衛隊長被提交去接受審訊時，他是被用有棚的大卡車接走的，裏面還有幾個手持鐵棒的契卡人員，一人坐在司機身旁。在沃伊諾夫大街，當汽車駛過倉庫的一面高牆時和司機坐在一起的人員突然轉換一下方向盤，使汽車朝一座房屋衝去。司機抓回方向盤矯正了汽車方向，汽車的側面碰到房屋牆上，避免車禍發生。但基洛夫的警衛隊長鮑利索夫已被人用鐵棒打死了。當時醫生作了假鑑定，指鮑利索夫是因車禍而死，他們當中有些人活到蘇共“二十大”時說鑑定書是被迫做出的，鮑利索夫是被很重的金屬鐵棒打在頭上致死的。
從這個案件的發生，以及整個偵查過程都可以看到有一隻有力的手在指揮整個事件的進行，絕非尼古拉·耶夫的個人行爲。因此無論斯大林是否指使這次謀殺，但他都會最大程度地利用這件事消滅他的對手。
基洛夫被刺事件至今是一個案情撲朔迷離的歷史疑案。兇手尼古拉也夫雖然當場被捕,並由當天趕到列寧格勒的斯大林親自審問，但審訊記錄始終沒有公佈，尼古拉·耶夫當月即被槍決。無論基洛夫案的真相如何，有一點十分清楚，即這個事件給斯大林提供了徹底清洗一切反對派(包括潛在的對手)、鞏固自己權力地位的機會和採取種種非法手段以達到上述目的的藉口。
當天，斯大林等領導人趕到出事地點，親自過問這一案件。最初，政府宣佈暗殺是白衛恐怖分子乾的，並處決了104名白衛恐怖分子。半個月後，蘇聯報紙宣佈，暗殺是托洛茨基、季諾維也夫反對派策劃的。
基洛夫案件發生後，1935年1月18日，聯共(布)中央就基洛夫暗殺案向各級黨組織發出一封祕密信。信中說：“必須肅清機會主義的泰然自若，這種態度是從這樣的錯誤假定出發的：隨着我們力量的增長，敵人似乎會變得愈來愈馴服和不傷害人。這種假定是根本錯誤的。它是右傾的死灰復燃，它要大家相信，敵人將悄悄地爬進社會主義，他們最後會變成真正的社會主義者。布爾什維克不應當高枕無憂和粗心大意。我們需要的不是泰然自若，而是警惕性，真正布爾什維克的革命警惕性。必須記住，敵人的處境愈是絕望，他們就愈想把極端手段作爲他們反蘇維埃政權鬥爭的垂死掙扎的唯一手段。必須記住這一點，必須保持警惕。”根據這一信件的要求，各級黨組織都開展“坦白和承認錯誤的運動”，許多人承認自己“警惕性不高”，“和‘敵對分子’有聯繫”，不少人被開除黨籍和被捕，其中大多是原先的反對派分子。在這期間，根據黨中央的指示，對所有黨證進行了一次審查。
1936年7月29日，聯共(布)中央向各級黨。組織發出了《關於托洛茨基·季諾維也夫反革命集團的間諜恐怖活動的問題》的密信中，再二次號召各級黨組織保持最大的警惕性，不管敵人僞裝得如何巧妙，都要善於識別人民的敵人。信中說：“現在已經證明，托洛茨基·季諾維也夫惡魔在反蘇維埃政權的鬥爭中，把我國勞動者的一切最兇惡的不共戴天的敵人——間諜、挑撥離間分子、破壞分子、白匪、富農等等都糾集在一起;這些分子同托洛茨基分子和季諾維也夫分子兩者之間已沒有任何區別了。我們的一切黨組織、全體黨員都應當瞭解，共產黨員隨時隨地都必須保持警惕性。在目前條件下，每一個布爾什維克必須具備的品質就是，要善於識別黨的敵人，不管他們僞裝得如何巧妙。”
1934年12月1日晚，根據斯大林的建議，蘇聯中央執行委員會和人民委員會通過《關於修改各加盟共和國現行刑事訴訟法典的決議》，規定對各個加盟共和國現行刑事法法典在偵察和審理恐怖組織和對蘇維埃政權工作人員進行恐怖活動有關事宜進行如下修改：凡屬恐怖組織和對蘇維埃政權工作人員進行恐怖活動的案件，偵察工作不能超過十天;控告結論在正式開庭審判前一晝夜交給被告;原告、被告雙方都不參加審判;不接受判決上訴書和赦免請求書;極刑判決被宣佈後立即執行。
當時很多幹部沒有意識到他們接受這個嚴酷與專橫決議的同時，也爲自己挖掘了墳墓。這是斯大林戰勝敵方，清洗大批黨內幹部最有力的武器，因爲這些人已經沒有什麼能保護他們自己了。斯大林指揮內務人民委員會可以爲所欲爲肆無忌憚，任何人都可以說成是人民敵人，是陰謀集團的成員。限期十天內可以使用酷刑強迫被告屈招，沒有上訴。
這個後來被稱作“特別程序”的規定爲政治清洗中採用非法手段羅織罪名、迫害異己打開了方便之門，成爲斯大林隨心所欲清洗政治對手的工具。此後，肅反運動被逐步推向高潮，其中第一步就是對所謂“列寧格勒總部”的審判。
全面展開
依據這個“特別程序”，審判開始了。1934年12月1日在各法院審判的幾十個和基洛夫謀殺案沒有任何關係的反革命罪行的案件，也送交蘇聯最高法院軍事委員會審理，幾乎所有被告都宣判死刑。當時斯大林的一名親信，蘇聯總檢察長維辛斯基叫檢察官們放心，不要有任何顧慮。他在1937年3月一次檢察工作人員會議上宣稱，大家應該記住斯大林同志的話，在一個社會的生活中，在我們自己的一生中，總有這樣的時刻法律成爲過時的東西而應該撇到一邊。他又從學術上論證了一個前提：“即在國家的罪行中，被告的口供是最重要的和決定性的證據。正因爲如此，內務人民委員會纔不惜以一切手段逼取口供。”
1934年12月22日,蘇聯政府發表偵查基洛夫案的通報，首次提到有一個名爲“列寧格勒總部”的恐怖組織，說尼古拉·耶夫即是這個組織的成員，該組織主要由季諾維也夫——加米涅夫反對派成員組成。12月27日，蘇聯政府公佈關於“列寧格勒總部”的控告結論，確認基洛夫被殺是該組織指使所爲，並說謀害基洛夫是該組織謀害斯大林和黨的其他領導人的長遠計劃的一部分。在立即處死尼古拉·耶夫後，1935年1月15日對“總部”主要成員進行了審判，季諾維也夫等人堅決否認自己與基洛夫案有任何牽連，儘管拿不出證據，法庭仍判處季諾維也夫十年有期徒刑，加米涅夫五年有期徒刑。
l月18日，蘇聯共(布)中央向全國黨組織發出祕密信，要求各地動員所有力量深挖敵人，由此開始了遍及全國的大逮捕，製造了無數冤案。清洗名單是逮捕人的重要依據。保安機構要負責提出“可疑分子”的名單，並按照一定的標準把他們加以分類。根據蘇共第二十次代表大會上公佈的材料，在大多數情況下，這些名單都是經過斯大林親自過目，由他或者他的最親密的同事，例如卡岡諾維奇、莫洛托夫、馬林科夫或者伏羅希洛夫，來決定名單上那些人的死活。
在1935至1936年初，鎮壓與逮捕在國內與黨內並沒有遇到明顯的反抗。雖然這些鎮壓引起了一些黨員極大不安，但沒有發生任何有組織的抗議行動。這種情況使斯大林更加大膽地實行他的清洗計劃。1936年9月26日，斯大林撤掉了雅哥達的內務人民委員的職務。在這前一天，斯大林與日丹諾夫曾從索契給卡岡諾維奇、莫洛托夫和其他政治局委員發了一份電報內容如下：“我們認爲絕對迫切需要任命葉若夫同志爲內務人民委員。雅哥達顯然沒有能力揭露托洛斯基分子和季諾維也夫分子集團。國家政治保安局在這件事情上至少落後四年。所有黨的幹部和大多數內務人民委員會的工作人員都正確認識到這一點。”這樣斯大林又多一個更兇殘陰險的劊子手。
隨着恐怖大清洗的加劇，作爲鎮壓專政機關的內務人民委員會變成爲一個重要政治部門。斯大林把它變成自己的權力工具。葉若夫接管內務人民委員會後，它的機構擴大了人員編制。在1936年8月1日-24日審判“托洛斯基、季諾維也夫分子恐怖中心案及1937年11月23日-30日所謂反對託派中心”案之後。斯大林於1937年2、3月的蘇共中央全會爲他的鎮壓清洗制定了一個理論依據。
在這次全會上，斯大林提出一個論點，即隨著蘇聯社會主義建設的順利發展，階級鬥爭日益激化。他宣稱黨內仍有隱藏的日本、德國和託派奸細陰謀集團。在這次全會上，除已有的破壞分子“代理人”、“叛徒”這些字眼之外，又多了一個新的涵義不清的字眼“兩面派”，從此在處決黨幹部時，就常常使用這個字眼。大規模的鎮壓與恐怖很快降臨在蘇共與人民頭上。
公開審判
三次要案的公開審判：
爲了給“大清洗”披上“合法”的外衣,1936年8月19日至24日，蘇聯最高法院軍事法庭舉行了第一次公開審判，被告是所謂的“托洛茨基—季諾維也夫聯合總部”成員季諾維也夫、加米涅夫、斯米爾諾夫等16人。審訊中，法庭沒有出示任何證據，所有的指控都建立在被告的“交代”和“承認”上，在沒有律師辯護的情況下，被告的“供詞”被作爲定罪的依據。法庭最後宣佈、季諾維也夫等與已被驅逐出境的托洛茨基相勾結，主使謀殺基洛夫的罪名成立，判處16名被告死刑並立即執行，沒收全部財產。判決後不到24小時，報紙即報道：死刑已經執行。這項審判稱之爲托洛斯基—季諾維也夫分子恐怖中心案件，被告中著名的人物有G.E.季諾維也夫，L.B.加米涅夫。這項審訊對所有被告都處以極刑的作法導致了以後更大規模的鎮壓。
對“聯合總部”的審判帶動了新一輪逮捕浪潮，根據審訊中被告的“供詞”，又挖出了一個所謂的“托洛茨基平行總部”，其成員有皮達可夫、拉狄克、索柯里尼科夫等人，罪名是策劃恐怖行動(其中一條就是暗殺基洛夫)，從事間諜活動，企圖挑起和加速同法西斯德國，日本的戰爭併力求在這次戰爭中打敗仗。
1937年1月23-30日，蘇聯最高法院軍事法庭對“平行總部”進行了肅反運動中第二次公開審判。被告中著名的人物有E.L.皮達可夫，K.S.拉狄克，索科爾尼科夫，L.P.謝列勃里亞利夫。這些人過去是布爾什維克和蘇維埃國家出名的活動家，積極參加了十月革命和蘇聯國內戰爭。但在二十年代中期卻是托洛斯基的積極擁護者，爲此被開除黨籍。在三十年代初，他們實際上和托洛斯基斷絕了關係，並恢復了黨籍，並在各人民委員部出版機構及其他單位中任領導職務，但還是被指控“接受託洛茨基指示”，“背叛祖國，從事偵察和軍事破壞工作，實行恐怖和暗害勾當”。與第一次公開審判的程序一樣，17名被告中皮達可夫等13人被判死刑，拉狄克等4人被判處十年或八年監禁。
由於拉狄克在受審時交代他與布哈林、李可夫等有“罪惡的聯繫”，1937年2月底，布哈林、李可夫在出席中央全會時被捕。3月初，聯共(布)召開中央全會，斯大林在會上作了《論黨的工作缺點和消滅托洛茨基兩面派及其他兩面派的辦法》的報告。他在報告中強調指出，托洛茨基主義已經“變成了一夥暗害分子、破壞分子、間諜和殺人兇手組成的寡廉鮮恥的、無原則的匪幫，他們是按照外國諜報機關的任務進行活動的。”
1937年2月23日，聯共(布)中央宣佈把布哈林、李可夫開除出黨。次年3月2—13日，蘇聯最高法院軍事法庭對所謂“右派托洛茨基聯盟”進行了肅反運動中第三次公開審判。布哈林等21名被告被以“謀害罪”和“叛國罪”起訴，其中包括布哈林、李可夫在內的19人被判處死刑。
布哈林在被捕前幾天給黨的幾位領導人寫了一封信。他在信中寫道：“我就要離開人間了，我不是在無產階級的斧鉞下低下了我的頭，無產階級斧鉞應該是無情的，但也應該是純潔的。我在萬惡的機器面前是無能爲力的，這臺機器居然使用了中世紀的方法，擁有無比強大的力量，大量地炮製有組織的造謠、誹謗。這些萬能的機構能把任何中央委員，任何黨員磨成粉末，把他變成叛徒，恐怖分子，暗害分子，間諜。如果斯大林對自己產生懷疑的話，那這個機構也會立即找到證據的。”
布哈林是在審訊人員威脅要把他的妻子與剛出生的兒子殺死纔開始交代並承認自己“罪行”。到一九三七年底，實際上所有反對派成員都被捕了，不管他們被捕時持什麼觀點。
三次公開審判都是肅反運動中爲欺騙國內外輿論而精心炮製的假案，這幾次審判所涉及的對象也只是肅反運動中無數被冤屈者的極少數代表。實際上，肅反運動所製造的冤假錯案遠比公開審判所暴露的多得多，清洗的對象從中央到基層幾乎包括所有的社會領域和各個階層。
“大清洗”究竟製造了多少冤案、殺害了多少無辜者?至今沒有一個確切的統計數字，但作爲一場政治性鎮壓運動，其規模之大、涉及面之廣、危害之深，在歷史上堪稱空前，它是斯大林領導蘇聯時期最黑暗的一頁。
斯大林死後，蘇聯開始重新審查這些案件。1956年2月，赫魯曉夫在第二十次黨代表大會上攻擊斯大林時報告說，過去兩年裏已有7679人被“恢復名譽”。他們中間大多數都已死去。最驚人的透露是，在1934年號稱爲“勝利者代表大會”上選出的134名黨中央委員會委員中，有98人，即佔全部委員的70.9%，多數在1937-1938年期間被逮捕和槍斃。
“大清洗”
1936年-1938年間，蘇聯除四個大的審判案外，在整個肅反運動中，黨、政、軍各部門都進行了大規模的清洗。其中冤殺和錯殺了許多人，鑄成肅反擴大化的錯誤。
從1922年至1928年，蘇聯公安和安全機關總共槍決了11271名各類犯罪分子。1930年一年就達到了20201人。1937年猛增到353074人，1938年的數字是326818人。1939年驟降到4201人，1940年再下降到1939人。
1934年1月至1947年12月31日止，蘇聯全國各勞動營的自然死亡人數爲96.21萬人。1937年死亡2.5萬人，1938年死亡9.5萬人，1939年死亡5.5萬人，1940年死亡4.67萬人，1942年猛增到24.89萬人。
1953年斯大林剛去世，蘇共中央主席團(即蘇共政治局)立刻要求安全部門提供有關在押“反革命犯罪分子”人數的詳盡資料。1954年2月，蘇總檢察長魯登科、公安部長克魯格洛夫、司法部長戈爾申寧向蘇共中央主席團連名遞交了相關報告。報告中說，從1921年到1954年2月1日止，以“反革命罪”判刑的人數是3777380人。其中被處死刑的有 642980人，被判勞改和監禁的有2369220人，被判流放和強制遷居的有765100人。在所有判刑人員中，對大約290萬人的判決是由政治保衛局工作組、“三人審判組”和特別專案組等非常規司法機關做出的。剩下的90萬人是由一般的法院、軍事法庭和最高法院做出的。
1992年，當時的俄羅斯聯邦國家安全部的檔案登記處處長向輿論界通報了蘇聯時期的全部“政治犯”資料。這些資料證明，從1917年1990年，總計有3853900人以政治罪名(反革命罪、國事罪)被判以各類刑罰，其中827995人被判處死刑。但是這裏有一小部分死刑判決沒有被執行，而是改判爲其他刑罰。另外，對一些刑事犯罪分子的處罰是以政治罪名進行的，這主要牽扯到國內的內戰和第二次世界大戰時期那些趁火打劫的打砸搶份子。
1954年，蘇公安部制訂了一張詳細的歷年安全部門抓獲和隨後被判以各類刑罰人員表。按照這份表格，剛結束內戰的1921年，被捕的全部人數是35800人，這裏包含了所有的在押刑事犯罪分子，因爲初期的蘇俄公安、安全部門是不分開的。1922年和1923年的相應數字是六千人和四千八百人，1928年增加到3.3萬人。這裏面含有部分刑事和經濟犯，如走私犯、貪污、受賄分子，反映了當時蘇共黨內的劇烈鬥爭。大大小小十幾個派系之間的鬥爭越來越帶有火藥味，一些反對蘇共中央多數派政策的黨內幹部被捕、被判刑。
1930年開始，政治保衛局逮捕了2.08萬人，創下了新的“紀錄”。這與剛剛開始的農業集體化有直接關係，許多農民因爲反抗強制集體化，被當局遷往人煙稀少的地區，開荒或是建立新城市。同時，蘇共黨內的反對派幾乎全部被捕。1931年，1932年，1933年的相應數字是180700人、141900人和239700人。
1936年是肅反運動的第一年。按照1937年的人口普查的結果，到1937年1月1日爲止，共有不少於180萬人關在監獄、勞改營或是住在強制定居點。1939年進行的另一次人口普查現示，相應數字達到260萬人，其中約100萬人是農村來的強制移民。
蘇聯全國勞動營管理總局領導層向公安部負責人以及後者向斯大林等黨和國家領導人的報告材料說，1940年，蘇聯全國勞動營管理總局的中央檔案裏保存了800萬人的個人資料。這些人包括正在服刑人員;刑滿釋放人員和死於服刑期間的人員。自1921至1953年間，總共有1000萬人曾於不同時間在古拉格服刑。在1930年，蘇聯全國各勞動營在營人數爲17500人，1933年達到33.4萬人。1937年達到119.6萬人，1940年達到166萬人。1941年達到了230萬人，新增加的犯人來自波蘭、波羅的海三國，以及大批觸犯勞動紀律的工人(蘇聯當局在三十年代末以嚴刑峻法對付工人，上班遲到或無故曠工會受到刑事處罰)。
從1941年6月蘇德戰爭爆發，至1944年12月止，蘇聯全國勞動營管理總局釋放了334萬人。僅從1941年6月12日至當年10月24日止，蘇聯最高蘇維埃主席團就釋放了60萬人，其中17.5萬人被徵招入伍。被釋放的人主要是觸犯勞動紀律的工人和不太嚴重的經濟犯，以及軍官和各類技術人員。1939至1944年止，在監獄的犯人數量徘徊於350.5萬人(1939年1月)和15.52萬人(1944年1月)之間。
與此同時，蘇聯全國各勞動營接收了255萬名新犯人，主要是投敵和爲德軍工作的人員。1948年新的運動使古拉格的人數在1950年達到了256.1萬人，創最高記錄。
蘇聯著名作家愛倫堡曾出席過對右派分子的審判。據他親眼目睹大多數被告精神委靡不振，非常消極。這些人用機械的語言交代，沒有本人所特有的語調與風度。因此有人猜想，葉若夫可能利用藥物或其他極端手段才獲得了被告的口供，因爲這些人畢竟是曾經出生入死的革命者。
黨內清洗
由於存在對斯大林的個人崇拜，領袖的意志可以凌駕於法制之上，在這次肅反運動中，許多人無辜遭到迫害。據估計，在誣陷爲與人民敵人同謀，破壞間諜活動，預謀進行恐怖行爲等形形色色的罪名之下，這次大清洗使500萬人受到牽連，30——40萬人被處決。1936年——1939年，有一半以上的黨員，即120萬人被逮捕。出席第十七次黨代會的1966名代表中有1108人(即半數以上)被捕，聯共(布)十七大選出的139名中央委員和候補委員中有98名(即70%)被逮捕和處決。17名政治局委員和候補委員中，除基洛夫外，有5人被殺。十一大上選舉的中央委員會的26名中央委員中有17名被處決或流放。
蘇維埃和政府機構也遭到“大清洗”運動的沉重打擊，1937——1938年間被捕並處決的部人民委員就有17人，加上他們的副手和下屬，數量還要翻幾倍。從1919年至1935年的31名政治局委員中，有20人慘死。在中央委員地區和省一級的黨委書記以及基層黨組織的書記中，這類情況更是嚴重。被捕的大多數黨員未經公開審判，甚至未經任何審判，就被處死或流放。
清洗行動
出席聯共(布)第十七大的1966名代表，有1108人因反革命罪被逮捕。十七大選出的中央委員和候補中央委員共139人，其中80%的委員被逮捕，並且全都被處死。列寧在世時的最後一屆黨中央政治局委員，即1923年4月第十二次黨代表大會後選舉產生的7名政治局委員中，除列寧早年逝世外，斯大林將其他5人(加米涅夫、托洛茨基、季諾維也夫、李可夫、託姆斯基)都置於死地。1919—1935年先後選出31名政治局委員，其中有20人遇害。所以有人說：“列寧創建的黨被斯大林消滅了。”
政府機關也遭到無情的清洗。列寧主持的第一屆人民委員會由15人組成，其中就有9人被鎮壓，托洛茨基在國外被暗殺。4人在1933年以前逝世。活過這場災難的只有斯大林一人。1935年進入人民委員會的委員中，有20人被處死，活下來的只有莫洛托夫、卡岡諾維奇、伏羅希洛夫、米高揚、安德列·安德列耶維奇·安德列耶夫和李維諾夫6人。1938年初人民委員會28個成員中有20人很快就被鎮壓。隨着人民委員和副人民委員的被鎮壓，他們的下屬多被牽連。1936年10月到1937年3月底，大約有2000名人民委員部工作人員被逮捕。國防部、重工業部、外交部，以及國家計劃委員會遭到毀滅性打擊。
軍隊也遭到可怕的清洗。20世紀30年代，蘇聯有5名元帥，3名遭鎮壓。海陸空三軍有3.5萬名軍人遭到從清除出軍隊到判刑、處死的迫害。
這些僅僅在是高層清洗中有據可查的數字。此外，“大清洗”究竟抓捕了多少人，殺了多少人，關押了多少人，流放了多少人，沒有準確的記載和答案。1991年6月，蘇聯解體前夕，蘇聯國家安全委員會主席克留奇科夫公佈了一個數字：1920年到1953年，蘇聯約有420萬人遭到鎮壓，其中200多萬人是在1937-1938年的“大清洗”中受到鎮壓的。
即使作爲“大清洗”工具的保安機構——內務人民委員會自身也無法倖免，其成員被不斷更新，以維持對領袖的忠誠或被當作替罪羊。肅反運動前期領導內務人民委員會的亞哥達因不能滿足斯大林的要求而於1936年9月被更加心狠手辣的葉若夫取代，不久亞哥達被捕並於1938年被處決。葉若夫在按斯大林旨意把肅反運動推向最高潮後，也遭到同樣下場，1938年7月被貝利亞取代，並在1940年4月1日被毫無根據地以“鎮壓蘇聯人民”的罪名而槍斃。
此外這場鎮壓運動波及到各個領域。科學家、歷史學家、生物學家、數學家、藝術家還有普通民衆數以幾千計地被迫害被流放。斯大林曾授意肅反機構槍決烏克蘭的幾百名民間歌唱藝人。這些民間藝人是民族文化的活化石，他們的歌曲從來沒有文字記錄，得靠師徒代代相傳才能將歌曲傳下去。音樂家肖斯塔科維奇說：“每當他們槍決一個民間歌唱藝人或者走方說書的藝人，幾百首偉大的音樂作品就和他一起消失了。”
斯大林的鎮壓同樣觸及到莫斯科的外國共產黨人。列寧的老戰友，瑞士的普拉敦和波蘭的加涅茨基、匈牙利庫恩·貝拉都被處決。波蘭共產黨因此解體，西烏克蘭和東白俄羅斯的共產黨也莫不如此。拉脫維亞、愛沙尼亞、立陶宛等國共產黨都有受到鎮壓，還有南斯拉夫、保加利亞、中國、朝鮮、伊朗、印度、日本等國的一些共產黨人。
運動結束
1938年末，因考慮到蘇聯人民的承受力已接近極限，同時肅反運動的目的也已基本達到，所以大規模的捕殺浪潮總算逐漸平息下來，也在不同程度上糾正了一些錯誤做法。在第二年的第十八次黨代會上，斯大林終於承認，在大清洗運動中，他犯下了不可原諒的錯誤。然而，由於斯大林並沒有從根本上認識肅反運動的錯誤，而是繼續把它當作鞏固集權體制的必要手段，因此肅反運動的餘波一直延續到戰爭前夕和戰爭初期，並在戰後再掀高潮。
1939年3月，聯共(布)召開第十八次代表大會，斯大林在會上作關於中央工作的總結報告中強調指出：“把托洛茨基、季諾維也夫、加米涅夫、雅基爾、圖哈切夫斯基、布哈林和其他惡棍之類的間諜、殺人兇手和暗害分子從蘇維埃組織中清洗出去，是完全必要的”。同時，他又說：“決不能說，在進行清洗時沒有犯過嚴重的錯誤。遺憾的是，所犯的錯誤竟比原來預料的還多。毫無疑問，我們今後已不再需要採用大批清洗的方法了。但是，1933-1936年的清洗終究是不可避免的，而且這次清洗基本上產生了良好的結果。
肅反運動的後果表現爲三個方面，其一，這場政治運動給蘇聯社會造成了嚴重創傷，各個領域的社會精華均受到摧殘，人們在生命安全和行動自由得不到法律保護的環境中精神受到極大壓抑，而且，在保安機構濫用非法刑訊手段和特務手段的情況下，誣告、假供盛行，人格被扭曲，社會道德水平嚴重滑坡，其消極影響禍及幾代人。在肅反運動中，濫捕無辜的行動大都在深夜進行，人人自危，風聲鶴唳，神經高度緊張，生怕夜間有人敲自己家門。許多住在高樓上的人爲免遭被捕後的嚴刑拷打和侮辱，在祕密警察敲門時，便縱身跳下，以死相抗。
其二，這場運動最終確立了高度中央集權體制的極端形式——斯大林個人專制。由於用持續數年的大規模鎮壓清除了從老布爾什維克到年輕一代幹部中可能構成對自己權力挑戰的對象，特別是整肅了在十七大上流露不滿的代表和中央委員會，斯大林終於穩固了自己至高無上的地位，登上了權力金字塔的頂端。
憑藉保安機構這一專政工具，斯大林得以不受法律制約，也不受黨和政府機關的制約，完全將個人凌駕於黨和國家之上，在黨和國家的名義下實行個人專制統治。他手中不僅掌握全部政治權力和軍事力量，而且把經濟全部命脈都掌握在自己手裏，使他能夠不受監督地，隨心所欲地支配全國的物質資源與財富。斯大林個人有權決定對外全部政策，他甚至把領導文學藝術和科學的權力全部集中在自己手裏。從這個意義上說，肅反運動是蘇聯確立“斯大林模式”體制的最後一步。
第三，大規模的恐怖鎮壓給經濟發展造成嚴重的障礙。由於成千上萬的幹部被鎮壓，生產在無組織狀態下進行。因此1937年到1939年連續二年鋼鐵產量處於停滯狀態。此時國際形勢越來越險惡，蘇聯面臨被侵略的危險。
