戰國中後期，秦惠文王採用張儀之計，利用末代蜀王開明蘆開鑿石牛道(又稱金牛道)，然後從苴國借道伐蜀，先滅蜀國，再回頭滅苴國和巴國，全取巴蜀之地。
秦滅巴蜀，給蜀地帶來了巨大的變化，就像一個外來文化突然瞬間取代了本土文化，大量的蜀人、羌人、巴人、氐人開始四散逃散(主要指貴族，歷史總是爲貴族而寫的，平民，不管由誰統治，他們就在那裏，種着同樣的莊稼，只是把租稅繳給不同的對象而已)。
蜀人向南遷徙到今川南及雲貴一帶，部分融合而成今天的彝族一支，雲南大理的“茶”姓，就源自於苴國的遺民;
氐人向西北遷徙到青海高原，部分融合而成今天的白馬藏族一支;
羌人向西遷徙至川西高原(冉人最初的居住地)，部分融合而成今天的羌族人一支;
巴人則向東回縮至川東及重慶一帶，部分形成今天的土家族一支;
巴人和蜀人的土著人因爲經歷歷次戰亂的洗禮，已經所剩無幾了，保存下來的多爲山區一帶(大巴上、巫山)的原住民，現在的巴人和蜀人基本都是後來遷徙至此的“客家人”。
秦國統治蜀地初期，繼續任用開明王子爲蜀侯，但實際上是個傀儡，實權掌握在蜀相的手裏，當然，蜀相是秦國人陳莊。
當蜀地基本穩定後，陳莊便在秦惠文王的授意下殺死了開明氏蜀侯，古蜀國的文明就到此截止了，蜀地正式進入中原文明的發展軌道。秦人的先進文化確實給蜀地帶來了極速的發展模式，蜀地此後成爲秦國爭衡天下的大糧倉和後勤基地。
蜀侯被殺後，秦國派公子通國爲新蜀侯，陳莊繼任蜀相，實權還是掌握在陳莊手中。一年後，秦惠文王死，秦武王立，朝局的變化爲蜀地的統治者帶來了憂懼和不安，陳莊於是背叛秦國，殺死蜀侯通國，宣佈自治，從此開啓了蜀地歷史上佔蜀爲王的新時代。
秦武王是個好戰之君，他在位4年時間，就發動了多次對外戰爭，連周天子他都不放在眼裏。對於陳莊的反叛，他毫不手軟的直接派左丞相甘茂和將軍司馬錯率大軍平叛。陳莊本來就是一個外來統治者，在蜀地沒有生根，所以很快就被甘茂擊敗斬殺。
蜀亂平定後，秦武王任命的蜀侯名字不詳。
到秦昭襄王的時候，任命不好管教的公子煇爲蜀侯，並命令其三年不得反秦。結果當年公子煇就在蜀地造反了，秦昭襄王命司馬錯再次平蜀，司馬錯殺公子煇及其黨羽27人，蜀地再次清淨。秦昭襄王爲避免歷史重演，將蜀侯國廢除，直接納入秦國郡縣制管理，蜀地自此成爲秦國的一個郡——蜀郡。
