秦始皇陵墓以水銀爲江河大海的記載見於《史記》，《漢書》中也有類似的文字。然而，陵墓中究竟有沒有水銀始終是一個謎。現代科技的發展爲驗證秦陵地宮埋水銀這一千古懸案提供了必要的前題條件。地質學專家常勇、李同先生先後兩次來始皇陵採樣。
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經過反覆測試，發現始皇陵封土土壤樣品中果然出現“汞異常”。相反其它地方的土壤樣品幾乎沒有汞含量。科學家由此得出初步結論：《史記》中關於始皇陵中埋藏大量汞的記載是可靠的。現代科技終於解開了地宮埋“水銀”的千古謎案。至於地宮爲何要埋入大量水銀?北魏學者酈道元的解釋是“以水銀爲江河大海在於以水銀爲四瀆、百川、五嶽九州，具地理之勢。”原來是以水銀象徵山川地理，與“上具天文”相對應。
謎團一：幽幽地宮深幾許?
據最新考古勘探資料表明：秦始皇陵墓地宮東西實際長260米，南北實際長160米，總面積41，600平方米。秦陵地宮是秦漢時期規模最大的地宮，其規模相當於5個國際足球場。通過考古鑽探進一步證實，幽深而宏大的地宮爲豎穴式。司馬遷說“穿三泉”，《漢舊儀》則言“已深已極”。說明深度挖至不能再挖的地步，至深至極的地宮究竟有多深呢?
神祕的秦始皇地宮曾引起了華裔物理學家丁肇中先生的興趣。他利用現代高科技與陳明等三位科學家研究撰文，推測秦陵地宮深度爲500至1500米。現在看來這一推測近乎天方夜譚。假定地宮挖至1000米，它超過了陵墓位置與北測渭河之間的落差。那樣不僅地宮之水難以排出，甚至會造成渭河之水倒灌秦陵地宮的危險。
秦始皇地宮模擬圖
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儘管這一推斷懸殊太大，但卻首開了利用現代科技手段探索秦始皇陵奧祕的先河。國內文物考古、地質學界專家學者對秦陵地宮深度也作了多方面的研究探索。根據最新鑽探資料，秦陵地宮並沒有人們想像的那麼深。實際深度應與芷陽一號秦公陵園墓室深度接近。
這樣推算下來，地宮坑口至底部實際深度約爲26米，至秦代地表最深約爲37米。這個數據應當說不會有大的失誤，這是依據目前勘探結果推算的。但是否如此尚有賴於考古勘探進一步驗證。
謎團二：地宮設有幾道門?
2002年9月17日，世人通過電視直播目睹了考古學家探測金字塔內部空間的過程。當考古學家從第一道石門洞口將機器人放進去之後，想不到機器人又碰上了一道石門。舉世矚目的金字塔考古工程只好擱淺。金字塔地宮可能不只兩道門。那麼，秦始皇陵墓當年建造了幾道墓門呢?秦陵地宮門道數量問題，其實《史記》中早有答案。只是未引起學者們的重視罷了。
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《史記》清楚的記載：“大事畢，已藏，閉中羨，下外羨門，盡閉工匠藏，無復出者。”棺槨及隨葬品全部安置放在中門以內。工匠正在中門以內忙活，突然間“閉中羨門，下外羨門。”工匠“無復出者”，也成了陪葬品。這裏涉及既有中羨門，又有外羨門，其中內羨門不言自明。地宮三道門似乎無可辨駁。
值得注意的是司馬遷中羨門用了個“閉”字，外羨門則有了個“下”字，說明中羨門是可以開合的活動門，外羨門則是由上向下放置的。中羨門可能是橫向鑲嵌在兩壁的夾槽中，是一道無法開啓的大石門。內羨門可能與中羨門相似。三道羨門很可能在一條直線上。
