很多人說太平天國的內鬥是自從蕭朝貴馮雲山死後才註定的，其實即便蕭朝貴馮雲山在世也是一樣，這件事怎麼看出來的呢?其實從當年楊秀清金田起義之前的一次生病就可以看出。
《天情道理書》記載：“追庚戌四月間，東王一旦忽又口啞耳聾，耳孔出濃(膿)，眼內流水，苦楚殆甚;一則因代弟妹贖病之勞，二則乃天父默中使成。楊秀清病重，蕭朝貴開始代理“首輔”之職，執掌上帝會的教務、教權，這也是他超越楊秀清的一次大好時機，蕭、楊爭鬥的暗流隨之涌現。
蕭朝貴主政期間，爲打擊、控制楊秀清採取了三種手段：
一是直接命令。道光三十年(1850)八月初一日，蕭朝貴在平南鵬化山約楊秀清戰妖完畢，直接對其下令：“四哥，爾先回去。小弟現停幾日，制服這處妖魔先，然後歸也。”楊秀清奉天兄之命由鵬隘山至鵬化山戰妖，然後又奉蕭朝貴之命先行返回，可見蕭朝貴已經能夠直接命令、控制楊秀清的行動。
二是詆譭中傷。楊秀清病重期間，上帝會內“未識皇上帝之聖心，皆私議東王幾成病廢，以致有不知尊敬東王，反爲裹讀東王”，楊秀清聲名大損。這種輿論導向只能是蕭朝貴所爲，而這種輿論也只有在蕭朝貴的默許下才有生存的空間。
三是孤立壓制。八月二十日，楊秀清病重期間，韋昌輝奉洪秀全之命欲接楊去花洲養病，天兄立即拒絕，接着“韋正又求天兄差清兄去金田安福，又求入藍廠安福”，蕭朝貴總以“不去得’夕、“總不去得”、“總不妨”等話拒不放人。很明顯，蕭朝貴拒絕楊秀清脫離自己的主要原因就是爲了孤立和控制楊秀清，杜絕楊秀清與洪秀全、馮雲山及地方實力派聯合，同時確保金田作爲上帝會大本營和指揮中樞的地位。
蕭朝貴在拒絕放人後，預感到自己的首輔地位並不穩固，而自己手中的權力或許遲早要交還給還在病中的楊秀清。他代天兄傳言給韋昌輝：“聯這今倘或三兩月下一回也不定。有事爾同爾妹夫商量理酌，切不好界人看小爾三星兄江山。聯所吩咐說話，爾切要記緊。”在蕭朝貴對韋昌輝的千叮萬囑中，我們不難看出他對權力的留戀，而他能夠倚賴的，主要還是韋昌輝。蕭朝貴的預感或許是對的，楊秀清在一個月後復出，天兄在天父復出後的三四個月只好保持沉默。
楊秀清在金田團營即將完成的重要時刻病癒登場，對他來說，是再立天父權能和自己威嚴的良機。楊秀清復出後，“有神附體傳言，比別人爲多。每次代天父上帝傳言時，嚴厲肅穆，責人罪惡，常指個人而宣傳其醜行。彼又勸人爲善及預言未來，或號令人應如何做法”，“每有所言即應驗”。楊秀清是要通過天父的頻繁出現，消滅蕭朝貴執政時期帶給他的一系列負面影響。
十月初一日，金田團營尚未完成。貴縣石達開部在八月中旬己經到達金田，象州石龍村譚要也在此時率衆抵達，但是陸川、博白、花洲、信宜等地的大批會衆尚在途中，所以天兄在九月十五日仍然強調：“千祈祕密，不可出名先，現不可扯旗，恐好多兄弟不得團圓矣。”
蕭朝貴直到九月還是堅持暫不起事的保守態度。十月初一日，楊秀清復出，否定蕭朝貴的保守政策，果斷採取迎接會衆的措施，不惜與清軍交火，大張旗鼓地準備起事。十月十八日，楊秀清派隊伍至大洋墟迎接前來金田團營的陸川上帝會賴九所部，與清軍激戰，賴九所部順利從上游渡得江，抵達金田。
十一月二十二日，楊秀清又派蒙得恩帶人前往花洲，二十四日在思旺好大敗得州協副將李殿元部，斬殺秦川巡檢張鋪，迎接洪秀全、馮雲山返回金田，花洲上帝會衆也到達金田，這就是著名的“迎主之戰”。洪秀全、馮雲山在八月份曾有與楊秀清會面的努力，但終因蕭朝貴的阻攔未能成行。這次三人終於相見，地點不是在花洲而是在金田。洪、楊、馮的再次會面，點燃了金田起義的火種，也宣告蕭朝貴超越楊秀清嘗試的失敗。同時也說明，即便蕭朝貴不死，他也很可能會和楊秀清爆發矛盾。太平天國內鬥的命運早已註定。
