這個的得從曾國藩創建湘軍說起。太平天國運動爆發後，清朝政府賴以生存的江南錢糧之地都被太平軍攪的一塌糊塗。曾國藩奉命創建湘軍部隊，但是朝廷根本拿不出那麼多錢來供養這支軍費遠超現役的八旗、綠營兵部隊的民團武裝。出不了錢只好出政策，允許曾國藩在南方以各種名目自籌資金。
於是曾國藩依靠在佔領區向過往的本地商人課以重稅的方式以及搶掠太平軍佔領區的錢糧來維持湘軍龐大的資金運轉。後來的李鴻章部淮軍、左宗棠部楚軍也都如法炮製，收復新疆的軍事行動所需軍費基本是靠商人胡雪巖通過借貸籌集而來。久而久之，內地各省均開始效仿，清朝統一的財政、人事制度逐漸被破壞。
清朝入關後，有一套比較完整的防備漢人奪權的軍事體系。八旗在各地都有駐軍，而各省的總督、巡撫和提督、總兵，相互之間又有牽制關係。這樣一來，地方上的封疆大吏無法做強做大，軍隊的訓練和調動，也能始終掌握在清廷的中央政府手裏滿人的手裏。
清廷編練新軍的目的何在?有人說是爲了與國際接軌，提高軍隊戰鬥力。這恐怕只是一個層面，還有一個層面，就是藉此機會加強中央集權!這是慈禧搞清末新政的重要策略，即“藉變法之名，以收集權之實”，後來的攝政王載灃只是繼承、強化罷了。
一場持續14年的太平天國運動，徹底打破了清朝中央與地方的關係結構，讓“內重外輕”、“滿重漢輕”的格局整個顛倒過來，後來出現的東南互保就是最有力的證明。清廷就是要打造直屬中央的新軍，破除地方督撫盤踞一方的格局。
但是太平天國之後，八旗形容虛設，綠營也不堪一擊，原先吆五喝六的滿蒙貴族，對軍隊實際上已經完全喪失了掌控。只不過當時清廷仍然還有點餘威，慈禧老太婆靠着他的政治手腕還能鎮得住地方的漢人實權派。
首先，新軍的來源決定了清政府管理的難度。所謂新軍，就是完全採用西式的訓練體系，裝備的軍隊。實際上是與舊式的八旗、綠營兵相區別。新軍規劃在全國編練三十六鎮，但是直到清朝滅亡，這個計劃都沒有完成，不過其中實力最強的北洋六鎮倒是完成了編練。新軍在招募兵員時，採用的是新式的募兵制，因爲待遇和前途都好於八旗、綠營，因此報名參加新軍的人甚多，這就給新軍的錄用提供了很大的挑選空間。最終被選爲新軍的一般都是文化水平比較高的一些人。
很簡單，知識分子那麼容易被控制嗎?爲什麼滿清能夠控制湘軍、淮軍?因爲湘軍、淮軍本質都是土農民，不學無術，識字的不多，只知道搶錢搶糧搶娘們，不難對付。但張之洞的自強軍，也就是武昌起義的骨幹力量，就完全不同。張之洞相對開明，強調唯纔是舉，對於有能力的軍官一律招攬。這樣一來，大量文化的知識分子，成爲自強軍的軍官。這裏面，頗有一些革命黨人或者傾向於革命的軍人。在庚子事變以後，稍有常識的新式知識分子，都明白滿清朽木不可雕，不推翻它必然亡國滅種。
