公元1627年，年僅23歲的明熹宗因縱於聲色而身患重病，不久即死去。魏忠賢深知皇帝對自己重要性，他曾想盡各種方法救皇帝的命。熹宗沒有兒子，張皇后在熹宗死前舉薦熹宗的弟弟信王朱由儉作爲皇位的繼承人，即明崇禎帝。崇禎帝早就不滿於魏忠賢、客氏的專權，因而上臺後便伺機除掉這兩個奸邪之人。御史、諫官們也一哄而上，上書譴責魏忠賢的罪惡行徑。崇禎帝順水推舟，首先把魏忠賢趕出宮廷，安置在鳳陽。魏忠賢還沒有到達鳳陽就得到了皇帝要殺他的消息，魏忠賢眼見大勢已去，便在旅舍內畏罪上吊自殺。崇禎帝下令將其碎屍萬段。與其一同作威作福的客氏先被趕到浣衣局服役，後被亂棒打死。魏忠賢與客氏的親族也大多被殺，依附他們的無恥之徒則被逐出朝廷。
魏忠賢的功與過
明熹宗臨死前曾專門叮囑崇禎說，魏忠賢“恪謹忠貞，可計大事”。人之將死，其言也善。朱由校在生命最後時刻對魏忠賢給予如此高的評價，固然摻雜着個人私情，但最主要的是他認識到了魏忠賢在處理“大事”方面的清醒和果決，尤其是在維護大局、知人善任、賞罰分明的關鍵問題上。
平心而論，魏忠賢爲鞏固個人權勢，未免有黨同伐異、殘忍歹毒的罪惡一面，但從他曾經力排衆議、大膽起用遼陽戰敗後遭受讒言的熊廷弼，拋開私怨、違心推薦趙南星、孫承宗等一批能臣直臣等諸多方面，可以看出，他還是心繫大明江山的。魏忠賢主政期間，國內形勢良好，遼東局勢平穩，這還是應該被認同和肯定的。
崇禎即位的時候，海內難民揭竿四起、關外清兵虎視眈眈，在這種內憂外患的嚴峻形勢下，朝廷迫切需要一位富有處理軍國大事經驗，以及善於把握動盪時局的“能人”來獨當一面，雖然無法扭轉國勢日衰、積重難返的敗亡趨勢，但也不至於在短時間內坍塌崩潰。但崇禎爲了整飭內政和平息民憤，更是爲了獨掌大權，藉着朝廷文武大臣的“倒魏”怒潮，以迅雷之勢，一舉肅清了以魏忠賢爲首的閹黨集團。
崇禎十七年三月十四日，也就是他煤山上吊自殺殉國前的第五天，崇禎在大勢已去、大廈將傾的絕望中，在聽到太監曹化淳說的那句“忠賢若在，時事必不至此”的話之後，終於領會到天啓皇帝臨終前，強調魏忠賢“恪謹忠貞，可計大事”的深意所在。幡然醒悟的同時，無力迴天的崇禎在精神上徹底崩潰了。收葬魏忠賢遺骸，既是他對魏忠賢價值和功績的重新肯定，也是對自己17年執政生涯的全盤否定。
