宋向金稱臣、納貢、割地，金規定宋高宗不許以無罪去首相。秦檜再次任相18年，獨攬朝政，排除異己，大興文字獄，極力貶斥主張抗金的官員，壓制抗金輿論，篡改官史。他還任用李椿年等推行經界法，丈量土地，重定兩稅等稅額，又密令各地暗增民稅十分之七八，使很多貧民下戶因橫徵暴斂而家破人亡。
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在一些資料上有提到，秦檜只有一個正妻王氏，但他的妻子王氏不能生育，因此才領養了兒子秦熺。另有野史記載秦檜有親生兒子，是秦檜與婢女所生，只能改姓送給人家。當時權傾一時的秦檜因爲妻子不能生育，肯定是有侍女小妾等人存在。
關於秦檜正妻王氏的身世，有記載仁宗時候宰相王珪的長女嫁給了着名文人李格非，生下的女兒就是大名鼎鼎的李清照。王珪第四子王仲岏之女嫁與秦檜爲妻，因此，李清照是王珪的外孫女，秦檜妻王氏是王珪的孫女，王氏與李清照是姑表姊妹的關係。
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但李清照與秦檜夫妻關係冷漠，並曾遭到秦檜兄秦梓的攻訐。即使在身陷訴訟、請託無門時，李清照寧肯求助於遠親綦崇禮，也不願求助於秦檜。
在杭州的嶽祠參拜，可以看見祠堂門口跪着秦檜和他老婆王氏，王氏赤身裸體，一絲不掛。在淮陽“皇都故里”太昊陵中，大院裏有雙膝下跪的秦檜夫婦，王氏依然是光着身子，袒胸露乳光亮。這是爲何呢?爲何讓一個女人赤身裸體的跪在那裏呢?
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紹興十一年高宗下旨，岳飛以毒酒賜死，岳雲以軍法斬首。高宗、秦檜殘害忠良，令人切齒痛恨，秦檜的老婆王氏對老公不但不加以規勸，反而助紂爲虐。後人爲表達對秦檜夫婦的痛恨，在許多地方爲二人塑像，扒光了王氏的衣服，以泄憤恨。
