洪武十三年正月，丞相胡惟庸稱他家的舊宅井裏涌出了醴泉，邀請明太祖前來觀賞。這是大明的祥瑞呀，朱元璋欣然前往，走到西華門時，一個名叫雲奇的太監突然衝到皇帝的車馬前，緊拉住繮繩，急得說不出話來。衛士們立即將他拿下，亂棍齊上，差點把他打死，可是他仍然指着胡惟庸家的方向，不肯退下。朱元璋這才感到事情不妙，立即返回，登上宮城，發現胡惟庸家牆道里都藏着士兵，刀槍林立。於是立即下令將胡惟庸逮捕，當天即處死。
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雲奇身爲內使，居西華門，離胡宅非常近，既然知道胡惟庸謀逆，爲何不先期告發，一定要事迫眉睫時，才攔駕告發?況且如果胡惟庸真要謀反，也是祕密埋伏，即使登上城牆也不可能看到刀槍林立。謀反這麼大的案件，胡惟庸當天下獄，當天就被處死，處置得如此匆忙，實在蹊蹺。據《明太祖實錄》記載，四天前，也就是正月甲午，中丞塗節已經告胡惟庸謀反，以明太祖猜忌多疑的性格，怎麼還會去胡惟庸家看所謂的祥瑞?可見，雲奇告變純屬子虛烏有。
胡惟庸案前後株連竟達十餘年之久，誅殺了三萬餘人，成爲明初一大案。事後朱元璋還親自頒佈《昭示奸黨錄》，告誡臣下，切以胡惟庸爲鑑。
胡惟庸案真相到底如何?明代法令嚴峻，多諱言此事。即使到清朝修《明史》時，也只是說胡惟庸被誅時“反狀未盡露”，這不免讓人生疑。
丞相胡惟庸
胡惟庸(?～1380)，鳳陽府定遠縣(今屬安徽)人，爲李善長的同鄉。在朱元璋攻克和州時，歸附紅巾軍，頗受寵信。
朱元璋登基，任命李善長爲左丞相，徐達爲右丞相。李善長是朱元璋攻下滁陽後，接納下來的謀士，指揮作戰，組織供應，事事皆能妥善處理。還在朱元璋稱吳王時，李善長便出任右相國，充分展現他裁決如流的才幹，爲功臣之首。洪武元年任左丞相，封韓國公，在朝廷上位列第一。徐達常年帶兵在外作戰，實權掌握在李善長手中。之後，他的兒子李祺又被朱元璋招爲駙馬，權勢更加顯赫，成爲朝廷中掌握實權的淮西集團首領。
淮西集團勢力的日益膨脹，威脅到皇權。朱元璋對他頗存顧忌，於是在洪武四年，以年高有病爲名，讓李善長告老還鄉，時年五十八歲。其實，朱元璋早就有意撤換李善長，還曾經向劉基請教合適人選。
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劉基說：“善長爲元勳舊臣，能調和諸將，不宜驟換。”朱元璋道：“善長屢言卿短，卿乃替他說情麼?朕將令卿爲右相。”劉基連忙頓首道：“臣實小材，何能任相?”可能劉基預料到在淮西集團當權的情況下，必然會受到排擠，故而堅決不肯任相職。朱元璋又問：“楊憲何如?”劉基答道：“憲有相材，無相器。”朱元璋又問：“汪廣洋如何?”劉基道：“器量褊淺，比憲不如。”
太祖又問及胡惟庸，劉基連連搖頭道：“不可不可，區區小犢，一經重用，僨轅破犁，禍且不淺了。”朱元璋默然無言。但是後來朱元璋還是根據李善長的推薦，任用了善於逢迎的胡惟庸。劉基嘆道：“惟庸得志，必爲民害。”胡惟庸得知後，便對劉基忌恨在心。不過，後來的事實證明，劉基的話還是有道理的。
因李善長的提攜，胡惟庸於洪武六年，進入中書省，與汪廣洋同任右丞相，左丞相空缺。胡惟庸入相後，他的精明幹練很快得到朱元璋的賞識。這期間，胡惟庸還將自己的侄女嫁給了李善長的弟弟李存義的兒子李佑爲妻，結成姻親，使得他與李善長關係更進一步。有這樣的元老重臣爲後盾，胡惟庸更加膽大妄爲。加上李善長的舊屬們也極力幫助他，胡惟庸可謂如魚得水。由於他逢迎有術，漸得朱元璋寵任。到洪武十年，進左丞相，位居百官之首，獨攬丞相之權。
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隨着權勢的不斷增大，胡惟庸日益驕橫跋扈，獨攬丞相大權，生殺黜陟，爲所欲爲。內外諸司所上的奏章，胡惟庸必先取閱，對自己不利的，就隱匿不上報。他任意提拔、處罰官員，各地喜好鑽營熱衷仕進之徒、功臣武夫失意者，都奔走於他的門下，送給他的金帛、名馬、玩好，不計其數。胡惟庸一時間權傾朝野，許多人都看他臉色行事，敢怒不敢言。
對於異己者，胡惟庸必定會打擊報復。之前，因入相問題，胡惟庸就與劉基有過節。恰恰甌閩間有一片空地名叫談洋，一向爲鹽梟佔據，劉基奏請設巡檢司進行管轄，鹽梟不服，反而糾衆作亂。劉基兒子劉璉將實情上奏，沒有事先向中書省報告。掌管中書省的胡惟庸認爲劉基蔑視他，越加憤怒，於是唆使刑部尚書吳雲彈劾劉基，誣稱談洋有王氣，劉基想據爲己有，用來修墓，應嚴加懲處。朱元璋便對劉基奪俸，劉基憂憤成疾，沒過多長時間就去世了。
大將軍徐達對胡惟庸的擅權亂政，深惡痛絕，便把他的劣跡上告朱元璋。誰知竟被胡惟庸聞知，忌恨在心，企圖誘使徐達家的守門人福壽謀害徐達。但因福壽揭發，未能得逞。可見胡惟庸氣量狹窄、心計毒辣。
